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motivo de ARN wcaG

El motivo de ARN wcaG es una estructura de ARN conservada en algunas bacterias que fue detectada mediante bioinformática . [1] Los ARN wcaG se encuentran en ciertos fagos que infectan a las cianobacterias . La mayoría de los ARN wcaG conocidos se encontraron en secuencias de ADN extraídas de bacterias marinas no cultivadas . Los ARN wcaG podrían funcionar como elementos reguladores cis , en vista de su ubicación consistente en las posibles regiones 5' no traducidas de los genes . Se sugirió que los ARN wcaG podrían funcionar además como riboswitches .

Los genes que se supone que están regulados por los ARN wcaG funcionan en la síntesis de exopolisacáridos o son inducidos por altas cantidades de luz . Estos últimos genes presumiblemente están relacionados con la fotosíntesis de las cianobacterias . Los ARN wcaG detectados en fagos purificados están aguas arriba de los genes inducidos resaltados. Aunque no se piensa que estos genes sean típicos de los fagos, se ha observado previamente que los fagos que infectan a las cianobacterias comúnmente incorporan dichos genes. [2] [3] [4]

Referencias

  1. ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, et al. (marzo de 2010). "La genómica comparativa revela 104 ARN estructurados candidatos de bacterias, arqueas y sus metagenomas". Genome Biol . 11 (3): R31. doi : 10.1186/gb-2010-11-3-r31 . PMC  2864571. PMID  20230605 .
  2. ^ Sullivan MB, Coleman ML, Weigele P, Rohwer F, Chisholm SW (mayo de 2005). "Tres genomas de Prochlorococcus cyanophage: características distintivas e interpretaciones ecológicas". PLOS Biol . 3 (5): e144. doi : 10.1371/journal.pbio.0030144 . PMC 1079782. PMID  15828858 . 
  3. ^ Rohwer F, Thurber RV (mayo de 2009). "Los virus manipulan el entorno marino". Nature . 459 (7244): 207–212. Bibcode :2009Natur.459..207R. doi :10.1038/nature08060. PMID  19444207. S2CID  4397295.
  4. ^ Lindell D, Jaffe JD, Coleman ML, et al. (septiembre de 2007). "La dinámica de expresión de todo el genoma de un virus marino y su hospedador revela características de coevolución". Nature . 449 (7158): 83–86. Bibcode :2007Natur.449...83L. doi :10.1038/nature06130. PMID  17805294. S2CID  4412265.

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