Software de código abierto utilizado en bioinformática para procesar secuencias de ADN
mothur es un paquete de software de código abierto para el procesamiento de datos bioinformáticos . [7] El paquete se utiliza con frecuencia en el análisis de ADN de microbios no cultivados. mothur es capaz de procesar datos generados a partir de varios métodos de secuenciación de ADN , incluidos pirosecuenciación 454, Illumina HiSeq y MiSeq, Sanger, PacBio e IonTorrent. [8] El primer lanzamiento de mothur se produjo en 2009. [9] El lanzamiento de mothur se anunció en una publicación en la revista Applied and Environmental Microbiology . [1] Hasta el 26 de octubre de 2022, el artículo que lanzaba mothur había sido citado por alrededor de 15.000 otros estudios de investigación.
Enlaces externos
Referencias
- ^ abcde Schloss, PD; Westcott, SL; Ryabin, T.; Hall, JR; Hartmann, M.; Hollister, EB; Lesniewski, RA; Oakley, BB; Parks, DH; Robinson, CJ; Sahl, JW; Stres, B.; Thallinger, GG; Van Horn, DJ; Weber, CF (2009). "Presentación de mothur: software de código abierto, independiente de la plataforma y con soporte comunitario para describir y comparar comunidades microbianas". Microbiología aplicada y ambiental . 75 (23). Sociedad Americana de Microbiología: 7537–7541. doi :10.1128/aem.01541-09. ISSN 0099-2240. PMC 2786419 . PMID 19801464.
- ^ "Mothur v.1.0.0". Wiki de Mothur . Consultado el 27 de noviembre de 2019 .
- ^ "mothur/mothur". GitHub . Consultado el 27 de noviembre de 2019 .
- ^ "Instalación". mothur wiki . Consultado el 27 de noviembre de 2019 .
- ^ "Versión 1.48.0". GitHub . Consultado el 16 de septiembre de 2022 .
- ^ "License.md". GitHub . Consultado el 27 de noviembre de 2019 .
- ^ Ricke, SC; Atungulu, GG; Rainwater, C.; Park, SH (2017). Sistemas y análisis de seguridad de alimentos y piensos. Elsevier Science. pág. 359. ISBN 978-0-12-849888-0. Recuperado el 13 de junio de 2018 .
- ^ Orcutt, BN; Sylvan, JB; Santelli, CM (2017). Avances recientes en geomicrobiología de la corteza oceánica. Temas de investigación de Frontiers. pág. 264. ISBN 978-2-88945-283-5. Recuperado el 13 de junio de 2018 .
- ^ Carter, DO; Tomberlin, JK; Benbow, ME; Metcalf, JL (2017). Microbiología forense. Forensic Science in Focus. Wiley. pág. 180. ISBN 978-1-119-06257-8. Recuperado el 13 de junio de 2018 .