stringtranslate.com

Modelo de red (biofísica)

Los modelos reticulares en biofísica representan una clase de modelos estadístico-mecánicos que consideran una macromolécula biológica (como ADN, proteína, actina, etc.) como una red de unidades, cada una de las cuales se encuentra en diferentes estados o conformaciones.

Por ejemplo, el ADN en la cromatina puede representarse como una red unidimensional, cuyas unidades elementales son el nucleótido , el par de bases o el nucleosoma . Los diferentes estados de la unidad pueden lograrse ya sea por modificaciones químicas (por ejemplo, metilación del ADN o modificaciones de las histonas unidas al ADN ), o debido a grados de libertad internos cuantificados (por ejemplo, diferentes ángulos del enlace que une dos unidades vecinas), o debido a eventos de enlace que involucran una unidad dada (por ejemplo, unión reversible de pequeños ligandos o proteínas al ADN , o unión/desunión de dos nucleótidos complementarios en el par de bases del ADN). [1]

Modelos de unión ADN-ligando

Modelos de fusión de doble hélice de ADN

Modelos fractales/de glóbulos espirales de ADN

Referencias

  1. ^ Teif VB, Rippe K. (2010). "Modelos reticulares estadístico-mecánicos para la unión proteína-ADN en la cromatina". J. Phys.: Condens. Matter . 22 (41): 414105. arXiv : 1004.5514 . Bibcode :2010JPCM...22O4105T. doi :10.1088/0953-8984/22/41/414105. PMID  21386588. S2CID  103345.

Lectura adicional