Agentes tampón para la investigación bioquímica y biológica
Los tampones de Good (también llamados tampones de Good ) son veinte agentes tampón para la investigación bioquímica y biológica seleccionados y descritos por Norman Good y sus colegas durante 1966-1980. [1] [2] [3] La mayoría de los tampones eran nuevos compuestos zwitteriónicos preparados y probados por Good y sus colaboradores por primera vez, aunque algunos ( MES , ADA , BES, Bicine ) eran compuestos conocidos que los biólogos habían pasado por alto anteriormente. Antes del trabajo de Good, pocos tampones de iones de hidrógeno entre pH 6 y 8 habían sido accesibles para los biólogos, y a menudo se habían utilizado tampones muy inapropiados, tóxicos, reactivos e ineficientes. Muchos tampones de Good se convirtieron y siguen siendo herramientas cruciales en los laboratorios biológicos modernos.
Criterios de selección
Good buscó identificar compuestos amortiguadores que cumplieran varios criterios que probablemente serían de valor en la investigación biológica.
- p K a : Debido a que la mayoría de las reacciones biológicas tienen lugar a un pH cercano a la neutralidad, entre 6 y 8, los tampones ideales tendrían valores de p K a en esta región para proporcionar la máxima capacidad de amortiguación allí.
- Solubilidad: Para facilitar su manejo y debido a que los sistemas biológicos se encuentran en sistemas acuosos, se requirió una buena solubilidad en agua. También se consideró beneficiosa una baja solubilidad en solventes no polares (grasas, aceites y solventes orgánicos), ya que esto tendería a evitar que el compuesto tampón se acumulara en compartimentos no polares en los sistemas biológicos: membranas celulares y otros compartimentos celulares.
- Impermeabilidad de la membrana: lo ideal es que un tampón no pase fácilmente a través de las membranas celulares, esto también reducirá la acumulación del compuesto tampón dentro de las células .
- Efectos mínimos de la sal: Los tampones altamente iónicos pueden causar problemas o complicaciones en algunos sistemas biológicos.
- Influencias en la disociación: Debe haber una influencia mínima de la concentración del tampón, la temperatura y la composición iónica del medio en la disociación del tampón.
- Interacciones catiónicas bien comportadas: si los tampones forman complejos con ligandos catiónicos , los complejos formados deben permanecer solubles. Lo ideal es que al menos algunos de los compuestos tampón no formen complejos.
- Estabilidad: Los tampones deben ser químicamente estables, resistiendo la degradación enzimática y no enzimática.
- Inercia bioquímica: Los tampones no deben influir ni participar en ninguna reacción bioquímica.
- Absorbancia óptica: Los tampones no deben absorber luz visible o ultravioleta en longitudes de onda superiores a 230 nm para no interferir con los ensayos espectrofotométricos comúnmente utilizados .
- Facilidad de preparación: Los tampones deben prepararse y purificarse fácilmente a partir de materiales económicos.
Lista de buffers de Good
La siguiente tabla presenta los valores de p K a a 20 °C. Los valores cambian aproximadamente 0,01 por cada grado de temperatura. [1] [3] El artículo original de Good de 1966 tenía dos tampones más antiguos (marcados en cursiva ) para comparación. En 1972, Good publicó una segunda lista con tres tampones más y en 1980 se agregaron cinco más.
Todos los agentes tampón cumplen su función porque contienen un grupo ácido (acetato, fosfato, sulfonato...) o un grupo básico (amino, piridilo...). Una consecuencia de esto es que pueden formar complejos con los iones biológicamente importantes Na + , K + , Mg2 + y Ca2 + y pueden competir por el ión metálico contenido en una metaloproteína . De hecho, Good afirmó que "puede ser que la búsqueda de la inercia biológica universal sea inútil".
Los tampones que contienen piperazina ( PIPES , HEPES , POPSO y EPPS ) pueden formar radicales y deben evitarse en estudios de procesos redox en bioquímica. [4] [5]
La tricina se fotooxida por acción de las flavinas y, por lo tanto, reduce la actividad de las enzimas flavonoides a la luz del día. Los ácidos libres de ADA, POPSO y PIPES son poco solubles en agua, pero son muy solubles como sales monosódicas. ADA absorbe la luz ultravioleta por debajo de los 260 nm, y ACES la absorbe a 230 nm y por debajo.
A lo largo de los años, se han investigado y reevaluado exhaustivamente p K a s y otros valores termodinámicos de muchos tampones de Good. [6]
En general, Norman Good y sus colaboradores atrajeron la atención de la comunidad científica hacia la posibilidad y los beneficios de utilizar tampones zwitteriónicos en la investigación biológica. Desde entonces, se han investigado otros compuestos zwitteriónicos, incluidos AMPSO, CABS, CHES, CAPS y CAPSO, para su uso en un contexto biológico.
Véase también
Referencias
- ^ ab Good, Norman E.; Winget, G. Douglas; Winter, Wilhelmina; Connolly, Thomas N.; Izawa, Seikichi; Singh, Raizada MM (1966). "Amortiguadores de iones de hidrógeno para la investigación biológica". Bioquímica . 5 (2): 467–477. doi :10.1021/bi00866a011. PMID 5942950.
- ^ Good, Norman E.; Izawa, Seikichi (1972). Tampones de iones de hidrógeno . Methods Enzymol. Vol. 24. págs. 53–68. doi :10.1016/0076-6879(72)24054-x. ISBN 978-0-12-181887-6. Número PMID 4206745.
- ^ ab Ferguson, WJ; Braunschweiger, KI; Braunschweiger, WR; Smith, JR; McCormick, JJ; Wasmann, CC; Jarvis, NP; Bell, DH; Bueno, NE (1980). "Tampones de iones de hidrógeno para investigaciones biológicas". Anal. Bioquímica . 104 (2): 300–310. doi :10.1016/0003-2697(80)90079-2. PMID 7446957.
- ^ Grady, JK; Chasteen, ND; Harris, DC (1988). "Radicales de los tampones de "Good"". Anal. Bioquímica . 173 (1): 111–115. doi :10.1016/0003-2697(88)90167-4. PMID 2847586.
- ^ Kirsch, M.; Lomonosova, EE; Korth, H.-G.; Sustmann, R.; de Groot, H. (1998). "Formación de peróxido de hidrógeno por reacción de peroxinitrito con HEPES y aminas terciarias relacionadas. Implicaciones para un mecanismo general". J. Biol. Chem . 273 (21): 12716–12724. doi : 10.1074/jbc.273.21.12716 . PMID 9582295.
- ^ Goldberg, R.; Kishore, N.; Lennen, R. (2002). "Cantidades termodinámicas para las reacciones de ionización de tampones" (PDF) . J. Phys. Chem. Ref. Data . 31 (2): 231–370. Código Bibliográfico :2002JPCRD..31..231G. doi :10.1063/1.1416902. Archivado desde el original (PDF) el 2008-10-06.