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Marco de lectura abierto aguas arriba

Un marco de lectura abierto ascendente ( uORF ) es un marco de lectura abierto (ORF) dentro de la región no traducida 5' (5'UTR) de un ARNm . Los uORF pueden regular la expresión génica eucariota . [1] [2] La traducción del uORF normalmente inhibe la expresión descendente del ORF primario. Sin embargo, en algunos genes como el GCN4 de levadura, la traducción de uORF específicos puede aumentar la traducción del ORF principal. [3] En las bacterias , los uORF se denominan péptidos líderes y se descubrieron originalmente sobre la base de su impacto en la regulación de los genes implicados en la síntesis o el transporte de aminoácidos .

Aproximadamente el 50% de los genes humanos contienen uORFs en su 5'UTR, y cuando están presentes, estos causan reducciones en la expresión de proteínas. [4] Los péptidos humanos derivados de uORFs traducidos se pueden detectar a partir del material celular con un espectrómetro de masas . [5]

Véase también

Referencias

  1. ^ Vilela C, McCarthy JE (agosto de 2003). "Regulación de la expresión génica fúngica a través de marcos de lectura abiertos cortos en la región 5' no traducida del ARNm". Microbiología molecular . 49 (4): 859–67. doi : 10.1046/j.1365-2958.2003.03622.x . PMID  12890013.
  2. ^ Lovett PS, Rogers EJ (junio de 1996). "Regulación de los ribosomas por el péptido naciente". Microbiological Reviews . 60 (2): 366–85. doi : 10.1128/MMBR.60.2.366-385.1996 . PMC 239448 . PMID  8801438. 
  3. ^ Hinnebusch, Alan G. (29 de agosto de 1997). "Regulación traduccional de GCN4 en levadura: una ventana a los factores que controlan la unión del ARNt iniciador al ribosoma*". Journal of Biological Chemistry . 272 ​​(35): 21661–21664. doi : 10.1074/jbc.272.35.21661 . ISSN  0021-9258. PMID  9268289.
  4. ^ Calvo SE, Pagliarini DJ, Mootha VK (mayo de 2009). "Los marcos de lectura abiertos ascendentes provocan una reducción generalizada de la expresión de proteínas y son polimórficos entre los seres humanos" (PDF) . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 106 (18): 7507–12. Bibcode : 2009PNAS..106.7507C . doi : 10.1073/pnas.0810916106 . PMC 2669787 . PMID  19372376. Archivado desde el original el 3 de diciembre de 2023 – vía MIT Libraries. 
  5. ^ Slavoff SA, Mitchell AJ, Schwaid AG, Cabili MN, Ma J, Levin JZ, Karger AD, Budnik BA, Rinn JL, Saghatelian A (enero de 2013). "Descubrimiento peptidómico de péptidos codificados por marcos de lectura abiertos cortos en células humanas". Nature Chemical Biology . 9 (1): 59–64. doi :10.1038/nchembio.1120. PMC 3625679 . PMID  23160002.