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Editor de moléculas

Un editor de moléculas es un programa informático para crear y modificar representaciones de estructuras químicas .

Los editores de moléculas pueden manipular representaciones de estructuras químicas en un espacio bidimensional simulado o en un espacio tridimensional , a través de gráficos de computadora 2D o 3D , respectivamente. Los resultados bidimensionales se utilizan como ilustraciones o para consultar bases de datos químicas . Los resultados tridimensionales se utilizan para construir modelos moleculares, generalmente como parte de paquetes de software de modelado molecular .

Los editores moleculares de bases de datos como Leatherface, [1] RECAP, [2] y Molecule Slicer [3] permiten modificar automáticamente un gran número de moléculas según reglas como "desprotonar ácidos carboxílicos" o "romper enlaces exocíclicos" que pueden ser especificadas por un usuario.

Los editores de moléculas suelen admitir la lectura y escritura de al menos un formato de archivo o notación de línea . Entre los ejemplos de cada uno se incluyen Molfile y la especificación simplificada de entrada de línea molecular (SMILES), respectivamente.

Los archivos generados por editores de moléculas se pueden visualizar mediante herramientas de gráficos moleculares .

Programas independientes

Subprogramas Java

Editores integrables con JavaScript

Véase también

Notas y referencias

  1. ^ Kenny, Peter W.; Sadowski, Jens (2005). "Modificación de la estructura en bases de datos químicas". Quimioinformática en el descubrimiento de fármacos. Métodos y principios en química medicinal. págs. 271–285. doi :10.1002/3527603743.ch11. ISBN 9783527307531.
  2. ^ Lewell, Xiao Qing; Judd, Duncan B.; Watson, Stephen P.; Hann, Michael M. (1998). "Procedimiento de análisis combinatorio retrosintético RECAP: una nueva y poderosa técnica para identificar fragmentos moleculares privilegiados con aplicaciones útiles en química combinatoria". Revista de información química y ciencias de la computación . 38 (3): 511–522. doi :10.1021/ci970429i. PMID  9611787.
  3. ^ Vieth, Michal; Siegel, Miles G.; Higgs, Richard E.; Watson, Ian A.; Robertson, Daniel H.; Savin, Kenneth A.; Durst, Gregory L.; Hipskind, Philip A. (2004). "Propiedades físicas características y fragmentos estructurales de fármacos orales comercializados". Revista de química medicinal . 47 (1): 224–232. doi :10.1021/jm030267j. PMID  14695836.
  4. ^ "Ficha técnica de Biovia Draw" (PDF) . Dassault Systemes . Consultado el 25 de abril de 2023 .

Enlaces externos