Los alfacoronavirus (Alfa-CoV) son miembros del primero de los cuatro géneros ( Alfa- , Beta- , Gamma- y Delta- ) de coronavirus . Son virus de ARN monocatenario de sentido positivo que infectan a los mamíferos , incluidos los humanos . Tienen viriones esféricos con proyecciones superficiales en forma de maza formadas por trímeros de la proteína espiga y una envoltura viral .
Los alfacoronavirus pertenecen a la subfamilia Orthocoronavirinae de la familia Coronaviridae . Tanto el linaje Alfa como el Betacoronavirus descienden del acervo genético viral del murciélago . [1] [2] Los alfacoronavirus se conocían anteriormente como " coronavirus del filogrupo 1".
El género Alphacoronavirus es muy diverso, particularmente en murciélagos. La mayoría de las cepas originarias de murciélagos no se han aislado ni cultivado con éxito en el laboratorio. Los alfacoronavirus que infectan a otras especies de mamíferos se han estudiado mucho mejor; consulte la Lista de aislamientos vivos de coronavirus .
El nombre alfacoronavirus se deriva del griego antiguo ἄλφα ( álfa , "la primera letra del alfabeto griego ") y κορώνη (korṓnē, "guirnalda, corona"), que significa corona, que describe la apariencia de las proyecciones de la superficie vistas bajo microscopía electrónica. que se asemejan a una corona solar . [3]
El virión está envuelto y es esférico y mide entre 120 y 160 nm de diámetro y una capa central de aproximadamente 65 nm. Las glicoproteínas y los trímeros forman grandes proyecciones superficiales que crean la apariencia de una corona solar. Este género, al igual que otros coronavirus, tiene una proteína de pico con una máquina de fusión tipo I (S2) y un dominio de unión al receptor (S1). Se ensambla en un trímero. A diferencia de los coronavirus beta y gamma, esta proteína no se divide en dos mitades. [4]
El genoma es un ARN monocatenario de sentido positivo con una longitud de 27 a 29 kilobases y una cola 3'- poliA . "Dos ORF grandes y superpuestos en el extremo 5' del genoma codifican las principales proteínas no estructurales expresadas como una proteína de fusión mediante desplazamiento del marco ribosómico ". Estos incluyen regiones con motivos de proteasa , helicasa y ARN polimerasa. Hay otros siete genes posteriores que codifican proteínas estructurales. "Estos se expresan a partir de un conjunto anidado de ARNm subgenómicos 3'-coterminal ".
Se sabe que ambos tipos de alfacoronavirus 1 , el coronavirus felino (FCoV) y el coronavirus canino (CCoV), existen en dos serotipos. El serotipo II se dirige a la aminopeptidasa N , mientras que se desconoce el receptor del serotipo I. La diferencia se debe a una proteína de pico diferente. [6] Existe un ancestro común para FCoV y CCoV. Este ancestro evolucionó gradualmente hasta convertirse en FCoV I y CCoV I. Una proteína S de un virus desconocido se recombinó en el ancestro y dio lugar a CCoV II. CCoV II se recombinó una vez más con FCoV para crear FCoV II. El CCoV II evolucionó gradualmente hasta convertirse en TGEV. Una eliminación de pico en TGEV crea PRCV. Todos estos virus se clasifican en el subgénero Tegacovirus . [6]
Se reconocen los siguientes subgéneros y especies: [7]