Un linaje genético incluye todos los descendientes de una secuencia genética dada, típicamente después de una nueva mutación . No es lo mismo que un alelo porque excluye los casos en los que diferentes mutaciones dan lugar al mismo alelo e incluye descendientes que difieren del ancestro por una o más mutaciones . La secuencia genética puede ser de diferentes tamaños, por ejemplo, un solo gen o un haplotipo que contiene múltiples genes adyacentes a lo largo de un cromosoma . Dada la recombinación , cada gen puede tener un linaje genético separado, incluso cuando la población comparte un solo linaje organismal . En microbios asexuales o células somáticas , los linajes celulares coinciden exactamente con los linajes genéticos y se pueden rastrear . [1]
Ordenación de linaje incompleta
Figura 1. Ordenamiento incompleto de linaje. El gen G tiene dos versiones (alelos), G0 y G1. El ancestro de A, B y C originalmente tenía solo una versión del gen G, G0. En algún momento, ocurrió una mutación y la población ancestral se volvió polimórfica, con algunos individuos con G0 y otros con G1. Cuando la especie A se separó, solo conservó G1, mientras que el ancestro de B y C permaneció polimórfico. Cuando B y C divergieron, B solo conservó G1 y C solo G0; ninguno de los dos era ahora polimórfico en G. El árbol del gen G muestra a A y B como hermanas, mientras que el árbol de especies muestra a B y C como hermanas.
La clasificación de linaje incompleta se da cuando el árbol filogenético de un gen no coincide con el de la especie . Por ejemplo, si bien la mayoría de los linajes genéticos humanos se fusionan primero con los linajes de chimpancés y luego con los de gorilas, también se dan otras configuraciones. [2]
Selección de linaje
La selección de linaje ocurre cuando la frecuencia de los miembros de un linaje cambia en relación con otro linaje. Es útil para estudiar alelos con efectos complejos que se manifiestan a lo largo de varias generaciones, por ejemplo, alelos que afectan la recombinación , la capacidad de evolución o el altruismo . [3] [4] La selección de linaje también es útil para determinar los efectos de las mutaciones en entornos altamente estructurados, como los tumores. [5]
El registro de secuencias de árboles describe métodos eficientes para registrar linajes supervivientes mientras se realizan simulaciones informáticas de genética de poblaciones . [8] Las simulaciones informáticas resultantes de "tiempo hacia adelante" ofrecen una alternativa a la teoría coalescente de "tiempo hacia atrás" . El registro de secuencias de árboles se ha incorporado al software de simulación de poblaciones SLiM . [9]
Referencias
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