Familia de bacterias
Las Rhodobacteraceae son una familia de Pseudomonadota del orden Rhodobacterales dentro del subgrupo alfa. [1] Como todos los Pseudomonadota , son gramnegativas . Contiene bacterias quimioorganótrofas y fotoheterótrofas . Muchas se encuentran en hábitats acuáticos.
Géneros
Géneros aceptados
Los siguientes géneros han sido publicados de manera efectiva y válida: [2] [3]
- Acidimangrovimonas Ren et al . 2019
- Actibacterium Lucena y otros . 2012
- Parque Aestuaribius et al . 2018
- Aestuariicoccus Feng et al . 2018
- Aestuariihabitans Yoon et al . 2014
- Parque Aestuariivita et al . 2014
- Estuario Yu et al . 2019
- Agaricicola Chu et al . 2010
- Albibacillus Hördt et al . 2020
- Albidovulum Albuquerque et al . 2003
- Albimonas Lim y otros . 2008
- Albirhodobacter Nupur et al . 2015
- Aliiroseovarius Park y otros , 2015
- Aliishimia Kim y otros , 2019
- Alkalilacustris Zhang et al . 2019
- Allgaiera Hördt y otros , 2020
- Allosediminivita Hördt et al . 2020
- Amaricoccus Maszenan et al . 1997
- Amylibacter Teramoto y Nishijima 2014
- Microbio antártico Zhang et al . 2020
- Antarctobacter Labrenz et al . 1998
- Aquicoco Feng et al . 2018
- Parque Aquimixticola et al . 2015
- Arenibacillus Kim y col . 2019
- Arenibacterium Baek y col . 2020
- Ascidiaceihabitans Kim et al . 2014
- Parque Boseongicola et al . 2014
- Brevirhabdus Wu y otros , 2015
- Carideicomes Wang et al . 2020
- Celeribacter Ivanova et al . 2010
- Cereibacter Suresh y otros , 2015
- Chachezhania Yuan et al . 2020
- Citreimonas Choi y Cho 2006
- Cognatishimia Wirth y Whitman 2018
- Concurso Wirth y Whitman 2018
- Cribrihabitans Chen et al . 2014
- Cypionkella Hördt et al . 2020
- Defluviimonas Foesel y otros , 2013
- Dinoroseobacter Biebl y otros . 2005
- Donghicola Yoon y otros , 2007
- Epibacterium Penesyan y otros , 2013
- Falsirhodobacter Subhash et al . 2013
- Fertoeibacter Szuroczki et al . 2021
- Flavimaricola Wirth y Whitman 2018
- Fluviibacterium Sun et al . 2020
- Frigidibacter Li y Zhou 2015
- Gemmobacter Rothe y otros . 1988
- Haematobacter Helsel et al . 2007
- Hahyoungchilella Kim y Lee 2020
- Halocynthiibacter Kim y otros . 2014
- Halodurantibacterium Lv y otros , 2015
- Halovulum Sun y otros . 2015
- Haslibacter Kim y otros . 2012
- Histidinibacterium Wang y otros . 2019
- Hwanghaeicola Kim et al . 2010
- Jannaschia Wagner-Döbler et al . 2003
- Jhaorihella Rekha et al . 2011
- Kandeliimicrobium Wang y otros . 2018
- Kangsaoukella Lee et al . 2020
- Lacimonas Zhong y otros . 2015
- Leisingera Schaefer et al . 2002
- Lentibacter Li y otros . 2012
- Limibaculum Shin y otros . 2017
- Limimaricola Wirth y Whitman 2018
- Litoreibacter Romanenko et al . 2011
- Litorisediminicola Yoon et al . 2013
- Parque Litorisediminivivens et al . 2016
- Litorivita Hetharua et al . 2018
- Loktanella Van Trappen et al . 2004
- Lutimaribacter Yoon y otros . 2009
- Maliponia Jung y otros . 2016
- Mameliella Zheng y otros , 2010
- Mangrovicoccus Yu et al . 2018
- Maribius Choi y otros . 2007
- Marimonas Thongphrom y otros , 2017
- Marinibacterium Li y otros . 2015
- Marinovum Martens et al . 2006
- Maritimibacter Lee y otros . 2007
- Marivita Hwang y otros . 2009
- Parque Marivivens y otros , 2016
- Meinhardsimonia Hördt et al . 2020
- Meridianimarinicoccus Ren et al . 2019
- Metilarcula Doronina y otros 2000
- Monaibacterium Chernikova et al . 2017
- Neptunicoccus Zhang et al . 2018
- Nereida Pujalte y col . 2005
- Nioella Rajasabapathy et al . 2015
- Oceanibium Chang et al . 2019
- Oceanicella Albuquerque et al . 2012
- Oceánicola Cho y Giovannoni 2004
- Oceaniglobus Li et al . 2017
- Octadecabacter Gosink y otros 1998
- Pacificibacter Romanenko et al . 2011
- Pacificitalea Hördt et al . 2020
- Parque Paenimaribius et al . 2019
- Paenirhodobacter Wang y otros . 2014
- Palleronia Martínez-Checa et al . 2005
- Paracoccus Davis 1969 (Listas Aprobadas 1980)
- Paradonghicola Lee y otros , 2019
- Paraphaeobacter Cai y otros . 2017
- Pararhodobacter Foesel y otros . 2013
- Parasedimentitalea Ding et al . 2020
- Paroceanicella corrig. Liu y cols . 2020
- Pelagicola Kim y otros . 2008
- Pelagimonas Hahnke y otros . 2013
- Pelagivirga Ji y otros , 2018
- Pelagovum Ren y otros , 2020
- Phaeobacter Martens y otros , 2006
- Phycocomes Zhu et al . 2019
- Planctomarina Giebel et al . 2013
- Planktotalea Hahnke y otros . 2012
- Pontibaca Kim y otros . 2010
- Ponticoccus Hwang y Cho 2008
- Parque Pontivivens et al . 2015
- Poseidonocella Romanenko y otros , 2012
- Primorskyibacter Romanenko y otros , 2011
- Profundibacter Le Moine Bauer et al . 2019
- Profundibacterium Lai y col . 2013
- Pseudoestuariivita Wirth y Whitman 2018
- Pseudodonghicola Hameed y otros . 2014
- Pseudogemmobacter Suman et al . 2019
- Pseudohalocynthiibacter Won y col . 2015
- Pseudomaribius Park y otros , 2018
- Pseudooceanicola Lai et al . 2015
- Pseudooctadecabacter Billerbeck et al . 2015
- Pseudophaeobacter Breider et al . 2014
- Pseudoprimorskyibacter Hördt et al . 2020
- Pseudopuniceibacterium Zhang et al . 2019
- Pseudorhodobacter Uchino et al . 2003
- Pseudoroseicyclus Park y otros , 2016
- Pseudoruegeria Yoon y otros . 2007
- Parque Pseudoseohaeicola et al . 2015
- Pseudotioclava Kim y Lee 2020
- Psychromarinibacter Qiao et al . 2017
- Pukyongiella Kim y otros , 2020
- Puniceibacterium Liu et al . 2014
- Qingshengfaniella Wang et al . 2021
- Rhodobaca Milford y otros . 2001
- Rhodobacter Imhoff y col . 1984
- Rhodobaculum Bryantseva y otros 2015
- Rhodophyticola Jung y otros 2019
- Rhodosalinus Guo y otros , 2017
- Rhodovulum Hiraishi y Ueda 1994
- Roseibaca Labrenz et al . 2009
- Roseibacterium Suzuki y otros 2006
- Roseicitreum Yu y otros . 2011
- Roseicyclus Rathgeber y otros , 2005
- Bacterias de la rosa de San Juan Sorokin y col . 2000
- Roseisalinus Labrenz y otros , 2005
- Roseivivax Suzuki et al . 1999
- Bacterias de la rosa de Shiba 1991
- Roseovarius Labrenz et al . 1999
- Rubellimicrobium Denner et al . 2006
- Rubribacterium Boldareva et al . 2010
- Rubricella Yang y otros . 2017
- Rubrimonas Suzuki et al . 1999
- Ruegeria Uchino y otros 1999
- Sagittula González et al . 1997
- Salinihabitans Yoon et al . 2009
- Salinovum Qu et al . 2017
- Salipiger Martínez-Cánovas et al . 2004
- Sedimentitalea Breider et al . 2014
- Sediminimonas Wang et al . 2009
- Seohaeicola Yoon y otros , 2009
- Shimia Choi y Cho 2006
- Silicimonas Crenn et al . 2016
- Sinirhodobacter corrig. Yang y cols . 2018
- Solirhodobacter Chu et al . 2020
- Sulfitobacter Sorokin 1996
- Tabrizicola Tarhriz et al . 2014
- Tateyamaria Kurahashi y Yokota 2008
- Thalassobius Arahal et al . 2005
- Thalassococcus Lee y otros . 2007
- Thioclava Sorokin et al . 2005
- Tranquillimonas Harwati y otros , 2008
- Tritonibacter Klotz y otros . 2018
- Tropicibacter Harwati y otros , 2009
- Tropicimonas Harwati et al . 2009
- Vannielia Hördt y otros , 2020
- Wenxinia Ying y otros , 2007
- Xinfangfangia Hu y otros , 2018
- Yoonia Wirth y Whitman 2018
- Youngimonas Hameed et al . 2014
Generales provisionales
Los siguientes géneros han sido publicados, pero no validados según el Código Bacteriológico : [3]
- " Aliisedimentitalea " Kim y otros . 2015
- " Alterinioella " Kong et al . 2021
- " Falsigemmobacter " Li et al . 2020
- " Jindonia " Park et al . 2017
- " Ketogulonicigenium " corrig. Urbance et al . 2001
- " Nitropelagi " Jeong y Lee 2016
- " Oceaniovalibus " Liu et al . 2012
- " Oceanomicrobium " Dai et al . 2021
- " Piezobacter " Takai et al . 2009
- " Pikeienuella " Park et al . 2021
- " Plastorhodobacter " Xie y col . 2015
- " Polymorphum " Cai et al . 2011
- " Pseudopontivivens " Park et al . 2018
- " Roseibacula " Nuyanzina-Boldareva y Gorlenko 2014
- " Zongyanglinia " Xu et al . 2021
CandidatoGéneros
Se han publicado los siguientes géneros de candidatos : [3]
- " Candidatus Halichondriibacter" corrig. Knobloch y col . 2019
- " Candidatus Kopriimonas " Quinn et al . 2012
Filogenia
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura [3] y la filogenia se basa en secuencias del genoma completo. [4] [a]
Véase también
Notas
- ^ Acidimangrovimonas , Aestuariibius , Aestuariicoccus , Aestuariihabitans , Aestuarium , Agaricicola , Albirhodobacter , Aliishimia , Alkalilacustris , Allgaiera , Amaricoccus , Arcticimicrobium , Aquicoccus , Arenibacillus , Arenibacterium , Carideicomes , Chachezhania , dobacter , Fertoeibacter , Fluviibacterium , Hahyoungchilella , Halodurantibacterium , Halovulum , Histidinibacterium , Kangsaoukella , Lacimonas , Limibaculum , Litorisediminicola , Litorisediminivivens , Litorivita , Marimonas , Meridianimarinicoccus , Methylarcula , Nioella , Oceanibium , Paenimaribius , Paradonghicola , Paraphaeobacter , Parasedimentitalea , Paroceanicella , Pelagivirga , Pelagovum , Phycocomes , Profundibacter , Profundibacterium , Pseudogemmobacter , Pseudohalocynthiibacter , Pseudomaribius , Pseudopuniceibacterium , Pseudoseohaeicola , Pseudothioclava , Psychromarinibacter , Pukyongiella , Qingshengfaniella , Rhodobaculum , Rhodophyticola , Roseibaca , Roseibacterium , Roseicyclus , Rubribacterium , Rubricella , Salinovum , Seohaeicola , Sinirhodobacter , Solirhodobacter , Tateyamaria , Xinfangfangia y Youngimonas no están incluidos en Este árbol filogenético.
Referencias
- ^ Véase la página web del NCBI sobre Rhodobacteraceae. Datos extraídos de los "Recursos de taxonomía del NCBI". Centro Nacional de Información Biotecnológica . Consultado el 19 de marzo de 2007 .
- ^ Parker, Charles Thomas; Wigley, Sarah; Garrity, George M (1 de enero de 2003). Parker, Charles Thomas; Garrity, George M (eds.). "Resumen taxonómico de las familias". Resúmenes de NamesforLife . doi :10.1601/tx.1037 (inactivo el 17 de abril de 2024).
{{cite journal}}
: CS1 maint: DOI inactivo a partir de abril de 2024 ( enlace ) - ^ abcd Euzéby JP, Parte AC. "Rhodobacteraceae". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 2 de junio de 2021 .
- ^ Hördt A, López MG, Meier-Kolthoff JP, Schleuning M, Weinhold LM, Tindall BJ, et al. (2020). "El análisis de más de 1000 genomas de cepas tipo mejora sustancialmente la clasificación taxonómica de Alphaproteobacteria". Frontiers in Microbiology . 11 : 468. doi : 10.3389/fmicb.2020.00468 . PMC 7179689 . PMID 32373076.
Lectura adicional
- Garrity GM, Holt JG (2001). "Esquema taxonómico de las arqueas y las bacterias" . En DR Boone, RW Castenholz (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology Volume 1: The Archaea and the deeper branching and phototrophic Bacteria (2.ª ed.). Nueva York: Springer Verlag. págs. 155-166. ISBN. 978-0-387-98771-2.