La Copa de Albania 1999-2000 ( en albanés : Kupa e Shqipërisë ) fue la cuadragésima octava temporada de la competición anual de copa de Albania . Comenzó el 21 de agosto de 1999 con la primera ronda y terminó el 6 de mayo de 2000 con el partido final. Los ganadores de la competición se clasificaron para la primera ronda de la UEFA Europa League 2000-01 . Tirana fue el campeón defensor, habiendo ganado su décima Copa de Albania la temporada pasada . La copa fue ganada por Teuta . [1]
Las rondas se jugaron en un formato de ida y vuelta similar al de las competiciones europeas. Si el marcador global era de empate después de ambos partidos, el equipo con mayor número de goles de visitante avanzaba. Si el número de goles de visitante era igual en ambos partidos, el partido se decidía mediante prórroga y, en caso necesario, una tanda de penaltis .
Los partidos se jugaron el 21 y 28 de agosto de 1999.
Los partidos se jugaron el 22 y 29 de enero de 2000.
En esta ronda participaron los 8 ganadores de la ronda anterior. Los partidos se jugaron el 3 y el 13 de febrero de 2000.
En esta ronda participaron los cuatro ganadores de la ronda anterior. Los partidos se jugaron el 12 y el 19 de abril de 2000.