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Espectrometría de masas dirigida

La espectrometría de masas dirigida es una técnica de espectrometría de masas que utiliza múltiples etapas de espectrometría de masas en tándem (MS n con n = 2 o 3) para iones de masa específica ( m/z ), en un tiempo específico. [1] Los valores de m/z y el tiempo se definen en una lista de inclusión que se deriva de un análisis previo.

Aplicaciones

El análisis dirigido permite el análisis exhaustivo de todos los iones, en cualquier rango de abundancia por encima del nivel de ruido, en cualquier ventana de tiempo en el experimento. Por el contrario, el análisis no dirigido, por lo general, solo permitiría la detección de los 50 a 100 iones más abundantes durante todo el tiempo del experimento. Esta limitación del análisis no dirigido lo hace menos adecuado para analizar muestras altamente complejas y altamente dinámicas, como el suero sanguíneo humano. [2]

Sin embargo, los métodos de utilización de la espectrometría de masas dirigida todavía se encuentran en una etapa primitiva, en el sentido de que la lista de inclusiones que se utiliza en el análisis dirigido suele ser introducida manualmente por los científicos. Además, solo se permite una lista de inclusiones para todo el experimento. Este proceso manual requiere mucho trabajo y es propenso a errores. Esto se debe en gran medida a la falta de software para controlar el espectrómetro de masas.

Automatización

Se han realizado algunos esfuerzos para automatizar la generación de listas de inclusión a través de la solución de software externo. En 2010, Wu et al. [3] introdujeron un método semiautomático en un esfuerzo por identificar glicopéptidos de baja abundancia. Implementaron la automatización a través de experimentos iterativos y el software de código abierto GLYPID. [4] Con una pequeña modificación, este enfoque se puede utilizar para analizar cualquier otra muestra simple o compleja. Además de la ventaja mencionada anteriormente, este enfoque semiautomatizado también ahorra una cantidad sustancial de tiempo y esfuerzo a los científicos en la selección manual de iones y la recalibración de los instrumentos.

Véase también

Referencias

  1. ^ Chicooree, Navin; Unwin, Richard D.; Griffiths, John R. (2015). "La aplicación de estrategias basadas en espectrometría de masas dirigidas a la detección y localización de modificaciones postraduccionales". Mass Spectrometry Reviews . 34 (6): 595–626. Bibcode :2015MSRv...34..595C. doi :10.1002/mas.21421. ISSN  0277-7037. PMID  24737647.
  2. ^ Gillette, Michael A (2013). "Análisis cuantitativo de péptidos y proteínas en biomedicina mediante espectrometría de masas dirigida". Nat Methods . 10 (1): 28–34. doi :10.1038/nmeth.2309. PMC 3943160 . PMID  23269374. 
  3. ^ Yin Wu; Yehia Mechref; Iveta Klouckova; Anoop Mayampurath; Milos V. Novotny; Haixu Tang (2010). "Mapeo de N-glicosilaciones de proteínas específicas del sitio mediante cromatografía líquida/espectrometría de masas y espectrometría de masas en tándem dirigida". Comunicaciones rápidas en espectrometría de masas . 24 (7): 965–972. doi :10.1002/rcm.4474. PMID  20209665.
  4. ^ "GlyPID". indiana.edu .