La Tercera División de Chipre 1979-80 fue la novena temporada de la liga de fútbol de tercer nivel de Chipre . El Iraklis Gerolakkou ganó su segundo título.
Doce equipos participaron en la Tercera División de Chipre 1979-80. Todos los equipos jugaron entre sí dos veces, una en casa y otra fuera. El equipo con más puntos al final de la temporada se coronó campeón. El primer equipo ascendió a la Segunda División de Chipre 1980-81 .
Los equipos recibieron dos puntos por una victoria, un punto por un empate y cero puntos por una derrota.