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Fosfodiesterasa 3

Figura 1: Función de la PDE3 en la transducción de señales mediada por cAMP y cGMP. PK-A: proteína quinasa A (dependiente de cAMP). PK-G: proteína quinasa G (dependiente de cGMP).

La PDE3 es una fosfodiesterasa . Las PDE pertenecen a al menos once familias de genes relacionados , que son diferentes en su estructura primaria , afinidad de sustrato , respuestas a efectores y mecanismo de regulación . La mayoría de las familias de PDE están compuestas por más de un gen. La PDE3 es clínicamente significativa debido a su papel en la regulación del músculo cardíaco, el músculo liso vascular y la agregación plaquetaria. Los inhibidores de la PDE3 se han desarrollado como productos farmacéuticos, pero su uso está limitado por los efectos arrítmicos y pueden aumentar la mortalidad en algunas aplicaciones.

Función

Las enzimas PDE3 intervienen en la regulación de la contractilidad del músculo liso vascular y cardíaco . Las moléculas que inhiben la PDE3 se investigaron originalmente para el tratamiento de la insuficiencia cardíaca , pero, debido a los efectos secundarios arrítmicos no deseados, ya no se estudian para esa indicación . No obstante, el inhibidor de la PDE3 milrinona está aprobado para su uso en la insuficiencia cardíaca en forma intravenosa . [1]

Tanto la PDE3A como la PDE3B se expresan en las células musculares lisas vasculares y es probable que modulen la contracción. Su expresión en el músculo liso vascular se altera en condiciones específicas, como niveles elevados de AMPc e hipoxia . [1]

Isoformas y genes

La familia PDE3 en mamíferos consta de dos miembros, PDE3A y PDE3B. Las isoformas de PDE3 son estructuralmente similares, contienen un dominio N-terminal importante para la localización y un extremo C-terminal. [2] La inserción de 44 aminoácidos en el dominio catalítico difiere en las isoformas de PDE3, y las porciones N-terminales de las isoformas son bastante divergentes. PDE3A y PDE3B tienen propiedades farmacológicas y cinéticas sorprendentemente similares, pero la distinción está en los perfiles de expresión y la afinidad por cGMP. [3]

La familia PDE3 está compuesta por dos genes , PDE3A y PDE3B . En las células que expresan ambos genes, el PDE3A suele ser dominante. Tres variantes diferentes de PDE3A (PDE3A1-3) son productos del uso alternativo del codón de inicio del gen PDE3A . El PDE3B codifica una única isoforma . [1] [4]

En su forma completa, tanto la PDE3A como la PDE3B contienen dos regiones de asociación de membrana hidrofóbicas N-terminales, NHR1 y NHR2 (figura 2). La diferencia entre las variantes PDE3A1-3 radica en si incluyen:

Se puede predecir que este último se encuentre exclusivamente en forma soluble / citosólica . [4] [5]

Distribución de tejidos

La PDE3A está implicada principalmente en la función cardiovascular y la fertilidad, pero la PDE3B está implicada principalmente en la lipólisis. [3] La Tabla 1 es una descripción general de la localización de las isoformas de PDE3.

En general, la PDE3 puede ser citosólica o estar unida a la membrana y se ha asociado a la membrana plasmática , el retículo sarcoplásmico , el aparato de Golgi y la envoltura del núcleo . [2]

La PDE3B está predominantemente asociada a la membrana y se localiza en el retículo endoplásmico y las fracciones microsomales . [1]

La PDE3A puede estar asociada a la membrana o ser citosólica, dependiendo de la variante y el tipo de célula en la que se expresa. [1]

Regulación

La actividad de PDE3A y PDE3B está regulada por varias vías de fosforilación . La proteína quinasa A y la proteína quinasa B activan PDE3A y PDE3B a través de la fosforilación en dos sitios de fosforilación diferentes (P1 y P2) entre NHR1 y NHR2 (figura 2). La hidrólisis de cAMP por isoformas de PDE3 también es inhibida directamente por cGMP , aunque PDE3B es solo ≈10% tan sensible a la inhibición de cGMP como PDE3A. [4] La PDE3B ha sido ampliamente estudiada por su importancia en la mediación del efecto antilipolítico y antiglucogenlítico de la insulina en los tejidos adiposos y hepáticos . La activación de PDE3B en los adipocitos está asociada con la fosforilación del residuo de serina por una proteína serina quinasa estimulada por insulina (PDE3IK). Al bloquear la activación de PDE3IK por la insulina y, a su vez, la fosforilación/activación de PDE3B, se puede antagonizar el efecto antilipolítico de la insulina. La activación de PDE3B disminuye las concentraciones de AMPc, lo que a su vez reduce la actividad de la proteína quinasa A. La proteína quinasa A es responsable de la activación de la lipasa , que induce la lipólisis , así como otras vías fisiológicas. [6] [4]

No está claro y queda fuera del alcance de este texto si las vías de fosforilación, que regulan la actividad de PDE3A o PDE3B, podrían servir como posibles objetivos farmacológicos en lugar del dominio catalítico de la propia enzima PDE3.

Estructura

Las PDE de mamíferos comparten una organización estructural común y contienen tres dominios funcionales, que incluyen el núcleo catalítico conservado, un extremo N regulador y el extremo C. El núcleo catalítico conservado es mucho más similar dentro de las familias de PDE, con aproximadamente un 80% de identidad de aminoácidos , que entre diferentes familias. Se cree que el núcleo contiene elementos estructurales comunes que son importantes para la hidrólisis de los enlaces fosfodiéster de cAMP y cGMP . También se cree que contiene determinantes específicos de la familia para las diferencias en la afinidad por los sustratos y la sensibilidad a los inhibidores. [6]

El dominio catalítico de PDE3 se caracteriza por un inserto de 44 aminoácidos, pero este inserto es exclusivo de la familia PDE3 y es un factor a la hora de determinar la estructura de un inhibidor potente y selectivo de PDE3 . [6]

La estructura cristalina de los dominios catalíticos de varias PDE, incluida la PDE3B, ha demostrado que contienen tres subdominios helicoidales:

  1. Región de plegamiento de ciclina N-terminal
  2. Región de enlace
  3. Haz helicoidal C-terminal [3] [1]

En la interfaz de estos dominios se forma una bolsa hidrofóbica profunda formada por residuos que están altamente conservados entre todas las PDE. Esta bolsa es el sitio activo y está compuesta por cuatro subsitios:

  1. Sitio de unión de metales (sitio M)
  2. Bolsillo central (bolsillo Q)
  3. Bolsillo hidrofóbico (bolsillo H)
  4. Región del párpado (región L) [3] [1]

El sitio M se encuentra en la parte inferior del bolsillo de unión hidrofóbico y contiene dos sitios de unión de metales divalentes . Los iones metálicos que pueden unirse a estos sitios son zinc o magnesio. El sitio de unión de zinc tiene dos residuos de histidina y dos de ácido aspártico que están absolutamente conservados entre las PDE estudiadas hasta la fecha. [3] [1]

Las porciones N-terminales de las PDE son muy divergentes y contienen determinantes asociados con propiedades reguladoras específicas de diferentes familias de genes. En el caso de la PDE3, esos determinantes son los dominios de asociación de membrana hidrofóbica y los sitios de fosforilación de la proteína quinasa dependiente de AMPc. [6]

Afinidad del sustrato

En un principio, las PDE3 se purificaron y se describieron como enzimas que hidrolizan tanto el GMPc como el AMPc con valores de Km de 0,1 a 0,8 μM. Sin embargo, la Vmax para la hidrólisis del AMPc es de 4 a 10 veces mayor que la Vmax para la hidrólisis del GMPc . [6]

Cuando se identificaron por primera vez las diferentes PDE, se aislaron dos tipos de PDE (PDE3 y PDE4) que mostraban una alta afinidad por el AMPc. La PDE3 mostró una alta afinidad tanto por el GMPc como por el AMPc, pero la PDE4 tenía una alta afinidad solo por el AMPc. Por esa razón, la PDE3 se denominó PDE inhibida por el GMPc para distinguirla de la PDE4. [6]

Se cree que la inserción de 44 aminoácidos en el dominio catalítico de las PDE3 está involucrada en la interacción de la PDE3 con su sustrato e inhibidores, pero esto aún está por establecerse. [6]

El mecanismo molecular propuesto de especificidad de nucleótidos cíclicos de las PDE es el llamado mecanismo de interruptor de glutamina.

En las PDE cuya estructura se ha resuelto, parece existir un residuo de glutamina invariante que estabiliza la unión del anillo de purina en el sitio activo (bolsillo de unión). El grupo g-amino del residuo de glutamina puede adoptar alternativamente dos orientaciones diferentes:

  1. La red de enlaces de hidrógeno favorece la unión de la guanina: selectividad de cGMP
  2. La red de enlaces de hidrógeno favorece la unión de adenina (selectividad de AMPc).

En las PDE que pueden hidrolizar tanto cGMP como cAMP (PDE3), la glutamina puede rotar libremente y, por lo tanto, cambiar entre orientaciones. [3] [1]

Sitio activo

A partir de estudios preliminares se derivó un modelo inicial de PDE, la topografía del sitio activo. Este modelo inicial se puede resumir en los siguientes pasos relacionados con la topografía del sitio activo del AMPc :

  1. Sustrato de AMPc con sus fracciones de adenina y ribosa en una relación "anti"
  2. El átomo de fosfato en el AMPc se une al sitio activo de la PDE, utilizando un residuo de arginina y una molécula de agua, que inicialmente estaba asociada con Mg 2+ . Un segundo residuo de arginina y el Mg 2+ también pueden desempeñar funciones durante la unión y/o desempeñar funciones en el siguiente paso.
  3. Ataque de S N 2 al fósforo por H 2 O con formación de un estado de transición bipirámide trigonal
  4. El 5'-AMP se forma como un producto "invertido". Las cargas electrónicas conservan la carga neta en general y a lo largo del estado de transición [7]

Inhibidores

Inhibidores de la PDE3 :

Se ha demostrado que la inhibición de PDE3A previene la maduración de los ovocitos in vitro e in vivo . [1] Por ejemplo, cuando los ratones quedan completamente deficientes de PDE3A, se vuelven infértiles. [2]

La agregación plaquetaria está muy regulada por nucleótidos cíclicos. La PDE3A es un regulador de este proceso y los inhibidores de la PDE3 previenen eficazmente la agregación plaquetaria. El cilostazol está aprobado para el tratamiento de la claudicación intermitente y se cree que inhibe la agregación plaquetaria y también la proliferación del músculo liso y la vasodilatación.

Las funciones más estudiadas de la PDE3B han sido en las áreas de señalización de insulina , IGF1 y leptina . [1] Cuando la PDE3B se sobreexpresa en las células β de los ratones, causa una secreción deficiente de insulina e intolerancia a la glucosa . [2]

Cáncer

La expresión de PDE3a se ha descrito como un biomarcador de sensibilidad al inhibidor de PDE3, Zardaverina, en diferentes tipos de cáncer. [8]

Asma

Al dirigirse a la PDE3 con dosis y tiempos óptimos, la enoximona previene la inflamación alérgica en modelos de inflamación alérgica de las vías respiratorias impulsados ​​por HDM. [9] Los inhibidores de la PDE3 enoximona y milrinona se pueden utilizar como fármaco de rescate en el asma bronquial potencialmente mortal/ asma grave aguda . [10] [11] [12]

Véase también

Referencias

  1. ^ abcdefghijkl Bender AT, Beavo JA (septiembre de 2006). "Fosfodiesterasas de nucleótidos cíclicos: regulación molecular para uso clínico". Pharmacological Reviews . 58 (3): 488–520. doi :10.1124/pr.58.3.5. PMID  16968949. S2CID  7397281.
  2. ^ abcd Lugnier C (marzo de 2006). "Superfamilia de la fosfodiesterasa de nucleótidos cíclicos (PDE): un nuevo objetivo para el desarrollo de agentes terapéuticos específicos". Farmacología y terapéutica . 109 (3): 366–98. doi :10.1016/j.pharmthera.2005.07.003. PMID  16102838.
  3. ^ abcdef Jeon YH, Heo YS, Kim CM, Hyun YL, Lee TG, Ro S, Cho JM (junio de 2005). "Fosfodiesterasa: descripción general de las estructuras proteínicas, posibles aplicaciones terapéuticas y progreso reciente en el desarrollo de fármacos". Ciencias de la vida celular y molecular  . 62 ( 11): 1198–220. doi :10.1007/s00018-005-4533-5. PMC 11139162. PMID 15798894. S2CID  9806864. 
  4. ^ abcd Maurice DH, Palmer D, Tilley DG, Dunkerley HA, Netherton SJ, Raymond DR, et al. (septiembre de 2003). "Actividad, expresión y orientación de la fosfodiesterasa de nucleótidos cíclicos en células del sistema cardiovascular". Farmacología molecular . 64 (3): 533–46. doi :10.1124/mol.64.3.533. PMID  12920188.
  5. ^ WO 03012030, Movsesian M, "Inhibidores y activadores selectivos de isoformas de fosfodiesterasas de nucleótidos cíclicos PDE3", publicado el 13 de febrero de 2003, asignado a la Oficina de Transferencia de Tecnología de la Universidad de Utah 
  6. ^ abcdefg Degerman E, Belfrage P, Manganiello VC (marzo de 1997). "Estructura, localización y regulación de la fosfodiesterasa inhibida por cGMP (PDE3)". The Journal of Biological Chemistry . 272 ​​(11): 6823–6. doi : 10.1074/jbc.272.11.6823 . PMID  9102399.
  7. ^ Erhardt PW, Chou YL (1991). "Un modelo topográfico para el sitio activo de la fosfodiesterasa III de c-AMP". Ciencias de la vida . 49 (8): 553–68. doi :10.1016/0024-3205(91)90254-9. PMID  1650876.
  8. ^ Nazir M, Senkowski W, Nyberg F, Blom K, Edqvist PH, Jarvius M, et al. (diciembre de 2017). "Dirigir la atención a las células tumorales en función de la expresión de la fosfodiesterasa 3A". Experimental Cell Research . 361 (2): 308–315. doi :10.1016/j.yexcr.2017.10.032. PMID  29107068. S2CID  19506507.
  9. ^ Beute J, Lukkes M, Koekoek EP, Nastiti H, Ganesh K, de Bruijn MJ y col. (2018). "Un papel fisiopatológico de la PDE3 en la inflamación alérgica de las vías respiratorias". Perspectiva de la JCI . 3 (2). doi : 10.1172/jci.insight.94888 . PMC 5821178 . PMID  29367458. 
  10. ^ Beute J (2014). "Tratamiento de emergencia del estado asmático con enoximona". Br J Anaesth . 112 (6): 1105–1108. doi : 10.1093/bja/aeu048 . PMID  24638233.
  11. ^ Schulz O, Wiesner O, Welte T y col. (2020). "Enoximona en el estado asmático". ERJ Res. Abierta . 6 (1): 00367–2019. doi : 10.1183/23120541.00367-2019 . PMC 7132035 . PMID  32280667. 
  12. ^ Sobhy A, Eldin DM, Zaki HV (2019). "El uso de milrinona versus el tratamiento convencional para el manejo del asma bronquial potencialmente mortal". Revista Abierta de Anestesiología . 13 (1): 12–7. doi : 10.2174/2589645801913010012 .