La temporada 2016-17 de la Niedersachsenliga es la novena temporada de la liga en el nivel cinco (V) del sistema de liga de fútbol alemán y la 27.ª en general.
La temporada 2016-17 vio cinco nuevos clubes en la liga, MTV Gifhorn, Hannoverscher SC , Blau-Weiß Bornreihe y TuS Bersenbrück , los cuatro ascendidos de las Landesligas , mientras que BV Cloppenburg descendió de la Regionalliga Nord . [1]
Los máximos goleadores de la temporada: [2]
Al final de la temporada se iba a celebrar un play-off de ascenso a la Regionalliga Nord . El subcampeón de la Niedersachsenliga y el campeón o, en el caso del Hamburgo, el equipo mejor clasificado que solicitaba una licencia de la Bremen-Liga , Oberliga Hamburg y Schleswig-Holstein-Liga se enfrentaron entre sí por dos plazas más en la Regionalliga. En la ronda de ascenso cada equipo se enfrentó solo una vez, y ascendieron los dos equipos mejor clasificados de la tabla final. Sin embargo, los dos últimos partidos se consideraron obsoletos y se jugaron como partidos amistosos porque los dos equipos ascendidos ya habían sido determinados.