La East of Scotland Football League 2012-13 fue la temporada número 84 de la East of Scotland Football League . La Universidad de Stirling fue la campeona defensora.
La liga se dividió en dos divisiones independientes: la Premier Division y la First Division . Esta temporada, compitieron 26 equipos en las dos divisiones, la mayor cantidad en la historia de la liga antes de la llegada de clubes juveniles en 2018-19 .
Whitehill Welfare consiguió su 16.º título de liga. La reconstrucción de la liga tras la temporada, tras la marcha de nueve clubes a la recién formada Lowland Football League, implicó que no descendiera de la Premier Division.
Los siguientes equipos han cambiado de división desde la temporada 2011-12.
Ascendido de Primera División
Descendido a Primera División
La Primera División vio aumentar su número de clubes a catorce con la incorporación del Astillero Burntisland a la liga. Craigroyston se adjudicó el título de la Primera División por segunda vez. La construcción de la liga después de la temporada significó que un tercer club ascendió a la Primera División.
Los siguientes equipos han cambiado de división desde la temporada 2011-12.
Descendido de la Primera División
Transferido desde el Reino de Caledonia AFA
Ascendido a Primera División