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Interferometría de biocapa

Figura 1 - Esquema general de una configuración de interferometría de biocapa
Figura 2 - La capa de ligando-analito crea una diferencia en la longitud del camino óptico, reflejando la luz incidente en dos patrones diferentes

La interferometría de biocapa ( BLI ) es una tecnología de biodetección óptica que analiza las interacciones biomoleculares en tiempo real sin necesidad de etiquetado fluorescente. [1] Junto con la resonancia de plasmón superficial , la BLI es una de las pocas tecnologías de biodetección sin etiquetas ampliamente disponibles , un estilo de detección que brinda más información en menos tiempo que los procesos tradicionales. [2] La tecnología se basa en la correlación de longitud de onda de cambio de fase creada entre patrones de interferencia de dos superficies únicas en la punta de un biosensor. [3] La BLI tiene aplicaciones significativas en la cuantificación de la fuerza de unión, la medición de interacciones de proteínas y la identificación de propiedades de la cinética de reacción, como las constantes de velocidad y las velocidades de reacción. [4]

Método

Descripción general del mecanismo

Figura 3 - Señal de reflectancia en función de la longitud de onda

La interferometría de biocapa mide la cinética y las interacciones biomoleculares en base a la interferencia de ondas . Para preparar el análisis BLI entre dos biomoléculas únicas, primero se inmoviliza el ligando sobre un biosensor biocompatible mientras el analito está en solución. [5] Poco después de esto, la punta del biosensor se sumerge en la solución y la molécula objetivo comenzará a asociarse con el analito, produciendo una capa sobre la punta del biosensor. Esto crea dos superficies separadas: el sustrato en sí y el sustrato que interactúa con la molécula inmovilizada en la punta del biosensor. [1] Esto crea esencialmente una interferencia de película delgada , en la que la capa creada actúa como una película delgada unida por estas dos superficies. La luz blanca de una lámpara de tungsteno se proyecta sobre la punta del biosensor y se refleja en ambas superficies, creando dos patrones de reflexión únicos con diferentes intensidades . [5] La Figura 2 expresa este fenómeno en una forma más general. El cambio de longitud de onda (Δλ) entre estos dos patrones de reflexión crea un patrón de interferencia (Figura 3) a partir del cual se pueden obtener todos los resultados deseados. [1] Dado que el cambio de longitud de onda es una medida directa del cambio en el espesor de la capa biológica y el espesor de la capa biológica cambiará en respuesta a las moléculas que se asocian y se disocian del biosensor, el patrón de interferencia permitirá el monitoreo en tiempo real de las interacciones moleculares en la superficie del biosensor. [6] En resumen, un cambio de longitud de onda positivo implica un aumento en el espesor de la biocapa y, por lo tanto, más asociación, mientras que un cambio de longitud de onda negativo implica una disminución en el espesor de la biocapa y, por lo tanto, más disociación. [6]

Formato "Sumergir y leer"

Las plataformas de interferometría de biocapas logran un alto rendimiento al utilizar un formato de "inmersión y lectura". [1] Las puntas del biosensor se transportan directamente a la muestra deseada y se "inmergen" en su compartimento respectivo, lo que elimina la necesidad de microfluidos y las complicaciones (obstrucción, purificación) que conlleva. [1] [7] Esta estructura suele estar soportada por un robot, y para lograrlo se combinan formatos de placa de 96 y 384 pocillos. [8] Este método de detección distintivo garantiza que la concentración y la viscosidad de la muestra y los índices de refracción variables rara vez afecten los resultados de BLI. [1] Por lo tanto, BLI encuentra un uso significativo en medios viscosos como el glicerol, donde otras técnicas pueden tener dificultades. [9]

Tipo y selección de biosensores

La interferometría de biocapa se basa en biosensores con una punta de fibra óptica sobre la que se inmoviliza el ligando. [1] La punta está recubierta además con una matriz biocompatible con la molécula objetivo para limitar cualquier unión no específica. Para que los cálculos de BLI funcionen, es necesario suponer que tanto la punta de fibra óptica como el ligando y el analito unidos actúan como superficies delgadas y reflectantes. [10] Los biosensores son desechables, lo que da como resultado bajos costos y alta disponibilidad comercial. [11] La selección del biosensor está determinada por los resultados de prueba deseados: análisis cinético, análisis cuantitativo o ambos. [12] La mayoría de los tipos de biosensores disponibles comercialmente se agruparán en una de estas tres categorías por el fabricante de BLI. [1]

Aplicaciones

Análisis de interacciones biomoleculares

Un uso clave de la interferometría de biocapa es analizar y cuantificar las interacciones entre conjuntos de biomoléculas. [1] Esto es extremadamente útil en la investigación farmacéutica, en la que la interacción biomolécula-membrana determina las características de un fármaco determinado. Debido a su capacidad para lograr datos de alta resolución y alto rendimiento, la BLI se ha utilizado para identificar propiedades biofísicas de bicapas lipídicas, lo que permite un método de estudio alternativo a los métodos in vitro tradicionales que se utilizan actualmente ( microscopía , electroforesis ). [6] Además, la BLI se puede utilizar para estudiar las interacciones entre complejos efectores y dianas. Cuando se puede utilizar el método tradicional de ensayo de desplazamiento de movilidad electroforética (EMSA), la BLI puede actuar como un sustituto adecuado si se desean los beneficios proporcionados (mediciones en tiempo real sin etiquetas). [3]

Figura 4 - Esquema general de la resonancia de plasmón superficial

Medición de la cinética biomolecular

La interferometría de biocapa se puede utilizar para analizar la cinética en sistemas biomoleculares. Los beneficios que aporta la BLI proporcionan información adicional sobre la cinética además de los métodos de punto final comúnmente utilizados, como el ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas (ELISA). [1] Los patrones de interferencia encontrados en los experimentos de BLI se pueden utilizar para calcular constantes de velocidad y otros datos cinéticos en interacciones biomoleculares. [13] La sensibilidad (relativamente) menor del sensor BLI da como resultado una menor respuesta a los cambios en la composición de la muestra. Como resultado, la BLI también se puede utilizar para investigar los efectos alostéricos en los cambios conformacionales de las enzimas. [14]

Características distintivas

Tanto BLI como SPR son tecnologías dominantes en el mercado de instrumentos sin etiquetas. [1] A pesar de compartir algunas similitudes en el concepto, existen diferencias significativas entre las dos técnicas. La SPR microfluídica se basa en una arquitectura cerrada para transportar muestras a un chip sensor estacionario (Figura 4). BLI, en cambio, utiliza un sistema abierto, agitando múltiples pocillos en una placa para transportar los sensores a las muestras sin necesidad de microfluídica . [6] Al ser un sistema cerrado, las fases de asociación y disociación de SPR están limitadas por el diseño de la tecnología. El diseño de placa abierta de BLI da como resultado límites de longitud de asociación y disociación determinados por la evaporación de la muestra. [15] La SPR es fácilmente reproducible debido a su microfluídica de flujo continuo. El diseño de placa de múltiples pocillos de BLI permite un rendimiento extremadamente alto en un lote. La configuración de ensayo en BLI puede, en condiciones estables, permitir la recuperación de muestras. La configuración de ensayo en SPR permite una mayor sensibilidad. Como resultado, los resultados de BLI a menudo se comparan con los resultados de SPR para su validación. [16]

Véase también

Referencias

  1. ^ abcdefghijk Apiyo D, Schasfoort R, Schuck P, Marquart A, Gedig ET, Karlsson R, Abdiche YN, Eckman Y, Blum SR, Schasfoort RB (2017). Manual de resonancia de plasmones de superficie . Real Sociedad de Química. ISBN 978-1-78801-139-6.OCLC 988866146  .
  2. ^ Syahir A, Usui K, Tomizaki KY, Kajikawa K, Mihara H (abril de 2015). "Técnicas de detección con y sin etiqueta para microarrays de proteínas". Microarrays . 4 (2): 228–244. doi : 10.3390/microarrays4020228 . PMC 4996399 . PMID  27600222. 
  3. ^ ab Müller-Esparza H, Osorio-Valeriano M, Steube N, Thanbichler M, Randau L (27 de mayo de 2020). "Análisis de interferometría de biocapa de la actividad de unión al objetivo de los complejos efectores CRISPR-Cas". Frontiers in Molecular Biosciences . 7 : 98. doi : 10.3389/fmolb.2020.00098 . PMC 7266957 . PMID  32528975. 
  4. ^ Rich RL, Myszka DG (febrero de 2007). "Análisis de interacción molecular en tiempo real, sin etiquetas y de alto rendimiento". Analytical Biochemistry . 361 (1): 1–6. doi :10.1016/j.ab.2006.10.040. PMID  17145039.
  5. ^ ab Müller-Esparza H, Osorio-Valeriano M, Steube N, Thanbichler M, Randau L (27 de mayo de 2020). "Análisis de interferometría de biocapa de la actividad de unión al objetivo de los complejos efectores CRISPR-Cas". Frontiers in Molecular Biosciences . 7 : 98. doi : 10.3389/fmolb.2020.00098 . PMC 7266957 . PMID  32528975. 
  6. ^ abcd Wallner J, Lhota G, Jeschek D, Mader A, Vorauer-Uhl K (enero de 2013). "Aplicación de la interferometría de biocapa para el análisis de interacciones proteína/liposoma". Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis . 72 : 150–154. doi :10.1016/j.jpba.2012.10.008. PMID  23146240.
  7. ^ Kamat V, Rafique A (noviembre de 2017). "Diseño de un ensayo cinético de unión en el biosensor de interferometría de biocapa (BLI) para caracterizar las interacciones anticuerpo-antígeno". Analytical Biochemistry . 536 : 16–31. doi : 10.1016/j.ab.2017.08.002 . PMID  28802648.
  8. ^ Petersen RL (octubre de 2017). "Estrategias que utilizan la tecnología de biosensores de interferometría de biocapa para la investigación y el desarrollo de vacunas". Biosensors . 7 (4): 49. doi : 10.3390/bios7040049 . PMC 5746772 . PMID  29088096. 
  9. ^ Lea WA, O'Neil PT, Machen AJ, Naik S, Chaudhri T, McGinn-Straub W, Tischer A, Auton MT, Burns JR, Baldwin MR, Khar KR, Karanicolas J, Fisher MT (septiembre de 2016). "Interferometría de biocapa basada en chaperonina para evaluar la estabilidad cinética de proteínas metaestables propensas a la agregación". Bioquímica . 55 (35): 4885–908. doi :10.1021/acs.biochem.6b00293. PMC 5524994 . PMID  27505032. 
  10. ^ Gao S, Zheng X, Wu J (2017). "Un biosensor competitivo basado en interferometría de biocapa para la detección rápida y sensible de saxitoxina". Sensores y actuadores B: Química . 246 : 169–174. Bibcode :2017SeAcB.246..169G. doi :10.1016/j.snb.2017.02.078. ISSN  0925-4005.
  11. ^ Abdiche Y, Malashock D, Pinkerton A, Pons J (junio de 2008). "Determinación de la cinética y las afinidades de las interacciones proteínicas utilizando un biosensor paralelo sin etiquetas en tiempo real, el Octet". Analytical Biochemistry . 377 (2): 209–217. doi : 10.1016/j.ab.2008.03.035 . PMID  18405656.
  12. ^ Yu Y, Mitchell S, Lynaugh H, Brown M, Nobrega RP, Zhi X, et al. (enero de 2016). "Comprensión de los sensores de ForteBio para la detección cinética y de epítopos de alto rendimiento para anticuerpos purificados y sobrenadante de cultivo de levadura". Journal of Biomolecular Screening . 21 (1): 88–95. doi : 10.1177/1087057115609564 . PMC 4708621 . PMID  26442912. 
  13. ^ Wilson JL, Scott IM, McMurry JL (noviembre de 2010). "Biodetección óptica: cinética de la unión de la proteína A-IGG mediante interferometría de biocapa". Educación en bioquímica y biología molecular . 38 (6): 400–407. doi :10.1002/bmb.20442. PMID  21567869. S2CID  29689214.
  14. ^ Shah NB, Duncan TM (febrero de 2014). "Interferometría de biocapa para medir la cinética de las interacciones proteína-proteína y los efectos de los ligandos alostéricos". Journal of Visualized Experiments (84): e51383. doi :10.3791/51383. PMC 4089413. PMID 24638157  . 
  15. ^ Abdiche Y, Malashock D, Pinkerton A, Pons J (junio de 2008). "Determinación de la cinética y las afinidades de las interacciones proteínicas utilizando un biosensor paralelo sin etiquetas en tiempo real, el Octet". Analytical Biochemistry . 377 (2): 209–217. doi : 10.1016/j.ab.2008.03.035 . PMID  18405656.
  16. ^ Yang D, Singh A, Wu H, Kroe-Barrett R (septiembre de 2016). "Comparación de plataformas de biosensores en la evaluación de la cinética de unión de alta afinidad anticuerpo-antígeno". Analytical Biochemistry . 508 : 78–96. doi : 10.1016/j.ab.2016.06.024 . PMID  27365220.