La proteína inhibidora (IP) está situada en la matriz mitocondrial y protege a la célula contra la hidrólisis rápida de ATP durante la isquemia momentánea . [1] En ausencia de oxígeno, el pH de la matriz cae. Esto hace que la IP se protone y cambie su conformación a una que pueda unirse a la sintetasa F1Fo y la detenga, evitando así que se mueva en dirección inversa e hidrolice ATP en lugar de fabricarlo. Cuando finalmente se incorpora oxígeno al sistema, el pH aumenta y la IP se desprotona. La IP se disocia de la sintetasa F1Fo y le permite reanudar su síntesis de ATP.