La heterotaquia se refiere a las variaciones en las tasas evolutivas específicas de linaje a lo largo del tiempo. En el campo de la evolución molecular , el principio de heterotaquia establece que la tasa de sustitución de sitios en un gen puede cambiar a través del tiempo. [1] Se ha propuesto que las posiciones que muestran cambios en la tasa de sustitución a lo largo del tiempo (es decir, sitios heterotaquios) son buenos indicadores de divergencia funcional. Sin embargo, parece que la heterotaquia es un proceso mucho más general, ya que la mayoría de los sitios variables de proteínas homólogas sin evidencia de cambio funcional son heterotaquios.
La hipótesis de la covariación es una forma específica de heterotaquia. Algunos estudios han propuesto modelos de divergencia funcional que también son heterotaquios. Además, algunos modelos de mezcla que no tienen en cuenta explícitamente el cambio de velocidad, sino las particiones de sitios que evolucionan a diferentes velocidades de sustitución relativas entre linajes, son matemáticamente heterotaquios.
Si no se tiene en cuenta la heterotaquia en las reconstrucciones filogenéticas, se pueden obtener árboles filogenéticos incorrectos . Por ello, Zhong et al. (2011) afirman que la heterotaquia es una de las razones de la variabilidad en las reconstrucciones del origen de los gnetofitos . [2]