Sir John Gordon, segundo baronet (c. 1632–1665) fue el hijo mayor de Sir John Gordon, primer baronet, de Haddo y Mary Forbes. Obtuvo el título de segundo baronet tras la ejecución de su padre por traición el 19 de julio de 1644, pero debido a la proscripción de su padre, estuvo en situación de pérdida hasta la Restauración en 1660. A su muerte en 1665 sin descendencia masculina, el título de baronet pasó a su hermano menor, que más tarde fue nombrado primer conde de Aberdeen .
Se casó con Mary Forbes, hija de Alexander Forbes, primer Lord Forbes de Pitsligo y Jean Keith, y tuvo descendencia: