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Genoma del adenovirus

Los genomas de los adenovirus son moléculas de ADN bicatenario (ds) lineales, no segmentadas , que suelen tener una longitud de 26-46 Kbp y que contienen entre 23 y 46 genes codificadores de proteínas . [1] El ejemplo utilizado para la siguiente descripción es el adenovirus humano E, un mastadenovirus con un genoma de 36 Kbp que contiene 38 genes codificadores de proteínas. [2] Si bien el número preciso y la identidad de los genes varían entre los adenovirus, los principios básicos de la organización del genoma y las funciones de la mayoría de los genes descritos en este artículo son compartidos entre todos los adenovirus.

Unidades de transcripción

Unidades de transcripción (en verde) y genes (genes codificadores de proteínas en rojo, otros genes en azul) del genoma del adenovirus humano E

Los 38 genes del genoma del adenovirus humano E están organizados en 17 unidades de transcripción , cada una de las cuales contiene entre 1 y 8 secuencias codificantes. [3] El empalme alternativo durante el procesamiento de los pre-ARNm producidos por cada unidad de transcripción permite que se produzcan múltiples ARNm diferentes a partir de una unidad de transcripción. [ cita requerida ]

Las unidades de transcripción E1A, E1B, E2A, E2B, E3 y E4 se transcriben sucesivamente en las primeras fases del ciclo reproductivo viral . Las proteínas codificadas por los genes dentro de estas unidades de transcripción participan principalmente en la regulación de la transcripción viral, en la replicación del ADN viral y en la supresión de la respuesta del huésped a la infección. [4]

Las unidades de transcripción L1-L5 se transcriben más tarde en el ciclo reproductivo viral y codifican principalmente proteínas que forman parte de los componentes de la cápside viral o que participan en el ensamblaje de la cápside. Las unidades de transcripción L1-L5 están reguladas por la misma región promotora y comparten el mismo sitio de inicio de la transcripción. Como resultado, la transcripción de las cinco unidades de transcripción tardía comienza en el mismo punto del ciclo reproductivo viral. [5]

La transcripción de los pre-ARNm que comienzan en el promotor tardío se termina aleatoriamente en uno de los cinco sitios de terminación, lo que produce una población de transcripciones de cinco longitudes diferentes. Los pre-ARNm de cualquier longitud dada se empalman alternativamente para producir entre 1 y 4 ARNm diferentes que codifican para un número correspondiente de proteínas. [ cita requerida ]

Genes codificadores de proteínas

Los nombres, ubicaciones y propiedades de los 38 genes codificadores de proteínas en el genoma del adenovirus humano E se dan en la siguiente tabla. [6] [7]

Se conocen las funciones de muchas proteínas de adenovirus: [5]

Referencias

  1. ^ "Virus: genomas completos". NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
  2. ^ "Genoma del adenovirus humano E". NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
  3. ^ "Descripción general del adenovirus humano E". NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
  4. ^ "Adenovirus". MicrobiologyBytes. Archivado desde el original el 20 de abril de 2013. Consultado el 17 de enero de 2013 .
  5. ^ ab Branton, Philip; Marcellus, Richard C. (2011). "23". En Nicholas H. Acheson (ed.). Adenovirus (2.ª ed.). John Wiley & Sons, Inc. {{cite book}}: |work=ignorado ( ayuda )
  6. ^ "Detalles proteicos del adenovirus humano E". NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
  7. ^ Russell, WC (enero de 2009). "Adenovirus: actualización sobre estructura y función". Journal of General Virology . 90 (Pt 1): 1–20. doi : 10.1099/vir.0.003087-0 . PMID  19088268.
  8. ^ "PHA3612: proteína alfa de internalización y degradación del receptor". NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
  9. ^ "PHA3620: glucoproteína de membrana beta CR1". NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
  10. ^ "PHA3615: proteína E3 gp19K". NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
  11. ^ "PHA3613: proteína E3 14.7K". NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .
  12. ^ "PHA3605: proteína de control E4orf4". NCBI . Consultado el 17 de enero de 2013 .