SF3B1

Gen codificador de proteínas en humanos

La subunidad 1 del factor de empalme 3B es una proteína que en los humanos está codificada por el gen SF3B1 . ^{[5] [6]}

Función

Este gen codifica la subunidad 1 del complejo proteico del factor de empalme 3b. El factor de empalme 3b, junto con el factor de empalme 3a y una unidad de ARN 12S, forma el complejo de ribonucleoproteínas nucleares pequeñas U2 (U2 snRNP). El complejo factor de empalme 3b/3a se une al pre-ARNm aguas arriba del sitio de ramificación del intrón de una manera independiente de la secuencia y puede anclar el U2 snRNP al pre-ARNm. El factor de empalme 3b también es un componente del espliceosoma menor de tipo U12. Los dos tercios carboxiterminales de la subunidad 1 tienen 22 repeticiones HEAT en tándem no idénticas que forman estructuras helicoidales similares a varillas. El empalme alternativo da como resultado múltiples variantes de transcripción que codifican diferentes isoformas. ^[6]

Interacciones

Se ha demostrado que SF3B1 interactúa con:

• CDC5L , ^[7]
• DDX42 , ^[8]
• PPP1R8 , ^[9]
• SF3B2 , ^{[8] [10]}
• SF3B3 , ^{[8] [10]}
• SF3B14 , ^{[8] [11]}

Relevancia clínica

Las mutaciones en este gen se han observado de forma recurrente en casos de leucemia linfocítica crónica avanzada, ^[12] síndromes mielodisplásicos ^[13] y cáncer de mama . ^[14] Las mutaciones de SF3B1 se encuentran en el 60%-80% de los pacientes con anemia refractaria con sideroblastos en anillo (RARS; que es un síndrome mielodisplásico) o RARS con trombocitosis (RARS-T; que es un síndrome mielodisplásico/neoplasia mieloproliferativa). También hay un conjunto emergente de evidencia que sugiere implicaciones de las mutaciones de SF3B1 que están implicadas en el melanoma orbitario.

Referencias

1. GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000115524 – Ensembl , mayo de 2017
2. GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000025982 – Ensembl , mayo de 2017
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6. "Gen Entrez: factor de empalme SF3B1 3b, subunidad 1, 155 kDa".
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10. Das BK, Xia L, Palandjian L, Gozani O, Chyung Y, Reed R (octubre de 1999). "Caracterización de un complejo proteico que contiene las proteínas espliceosómicas SAP 49, 130, 145 y 155". Biología molecular y celular . 19 (10): 6796–6802. doi :10.1128/mcb.19.10.6796. PMC 84676 . PMID  10490618. 
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12. Quesada V, Conde L, Villamor N, Ordóñez GR, Jares P, Bassaganyas L, et al. (diciembre de 2011). "La secuenciación del exoma identifica mutaciones recurrentes del gen del factor de empalme SF3B1 en la leucemia linfocítica crónica". Nature Genetics . 44 (1): 47–52. doi :10.1038/ng.1032. PMID  22158541. S2CID  205343043.
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Lectura adicional

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