La temporada 2008-09 de la Copa del Trono de Marruecos fue la 53.ª edición de la competición y comenzó el 22 de noviembre de 2008.
La copa la ganó el FAR de Rabat , que venció al Fath Union Sport en la final.
En esta ronda participaron equipos de la GNF 2. El sorteo se realizó el miércoles 25 de febrero de 2009.
En esta ronda participaron los clubes de Botola . El sorteo se realizó el jueves 26 de marzo de 2009.
El sorteo tuvo lugar el martes 14 de abril de 2009.
El sorteo tuvo lugar el martes 23 de junio de 2009.
El sorteo tuvo lugar el martes 23 de junio de 2009.
