La Copa del Rey 1999-2000 fue la 98.ª edición de la Copa del Rey .
La competición comenzó el 1 de septiembre de 1999 y concluyó el 27 de mayo de 2000 con la Final, celebrada en el Estadio Mestalla de Valencia .
Nota: El Barcelona no pudo jugar el partido de vuelta debido a un choque con partidos internacionales de la UEFA , lo que dejó al Barcelona con solo siete jugadores del primer equipo. Las normas de competición de la época para la Copa del Rey permitían a los equipos un máximo de tres canteranos por partido, dejando al Barcelona con una plantilla de diez jugadores para el partido de vuelta contra el Atlético de Madrid . Los diez jugadores del Barcelona se negaron a salir al campo como protesta contra la Federación Española de Fútbol ( RFEF ), perdiendo así el partido. [1]