Las fases eliminatorias de la Copa Libertadores 2007 se jugaron con partidos de ida y vuelta. El marcador global determina el equipo que avanza a la siguiente ronda, y se aplican los goles de visitante y la tanda de penales , en ese orden. No se juega tiempo extra .
Los equipos han sido clasificados del 1 al 8 (primeros clasificados de la fase de grupos) y del 9 al 16 (segundos clasificados de cada grupo) y los empates serán 1 contra 16, 2 contra 15, etc.
(*) Para evitar una final con dos equipos del mismo país, la CONMEBOL emparejó al Santos FC con el Grêmio en las Semifinales.[1]