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Dominio proteico de saposina

Los dominios de saposina se refieren a dos dominios proteicos conservados evolutivamente que se encuentran en la saposina y proteínas relacionadas (SAPLIP). Las saposinas son pequeñas proteínas lisosomales que sirven como activadores de varias enzimas lisosomales que degradan lípidos. Probablemente actúan aislando el sustrato lipídico de los alrededores de la membrana, haciéndolo así más accesible a las enzimas degradativas solubles . Todas las saposinas de mamíferos se sintetizan como una única molécula precursora ( prosaposina ) que contiene cuatro dominios de saposina-B , que producen las saposinas activas después de la escisión proteolítica, y dos dominios de saposina-A que se eliminan en la reacción de activación. [2]

Los dominios de saposina B también se encuentran en otras proteínas, la mayoría de las cuales desempeñan un papel en la interacción con las membranas. [2] [3] [4]

Clasificación

Los dominios de saposina (SapB1-SapB2) se encuentran en una amplia variedad de proteínas. Cada semidominio codifica dos hélices alfa en el dominio SapB, ​​lo que suma un total de cuatro. [5]

La prosaposina de los mamíferos (organización de dominios a continuación) es un miembro prototípico de la familia. También incluye los dominios SapA N- y C-terminales , ambos de los cuales se escinden proteolíticamente a medida que la proproteína madura. Se liberan cuatro pares conectados de dominios SapB1-SapB2, denominados secuencialmente Saposina-A a D. Algunas proteínas estrechamente relacionadas, como PSAPL1 y SFTPB, comparten la arquitectura y el mecanismo de escisión en su totalidad o en parte. Mientras que la prosaposina y PSAPL1 actúan en la degradación de lípidos lisosomales, SFTPB se libera en el surfactante pulmonar y desempeña un papel en la reorganización de los lípidos. [6]

Esquema de la estructura primaria de la prosaposina.

Sin embargo, proteínas como GNLY y AOAH no tienen un dominio SapA. Mientras que GNLY es esencialmente un SapB con extensiones N-terminales especializadas para lisar las membranas celulares de los patógenos, [7] la proteína ADAH utiliza el dominio SapB no escindido para dirigirse al compartimento intracelular correcto. [8]

El inserto específico de la planta es una variación inusual de los dominios SapB. Presenta una permutación circular en comparación con la topología habitual: en lugar de presentar una unidad SapB1-SapB2, está formado por una unidad SapB2-enlazador-SapB1 que parece derivada de la mitad de cada una de las dos unidades SapB. [5]

Proteínas humanas que contienen este dominio

Referencias

  1. ^ PDB : 2qyp ​, Rossmann M, Schultz-Heienbrok R, Behlke J, Remmel N, Alings C, Sandhoff K, Saenger W, Maier T (mayo de 2008). "Estructuras cristalinas de las saposinas humanas C y D: implicaciones para el reconocimiento de lípidos y las interacciones de membrana". Structure . 16 (5): 809–17. doi : 10.1016/j.str.2008.02.016 . PMID  18462685.
  2. ^ ab Munford RS, Sheppard PO, O'Hara PJ (agosto de 1995). "Las proteínas similares a la saposina (SAPLIP) llevan a cabo diversas funciones en una estructura de cadena principal común". Journal of Lipid Research . 36 (8): 1653–63. doi : 10.1016/S0022-2275(20)41485-3 . PMID  7595087.
  3. ^ Ponting CP (febrero de 1994). "La esfingomielinasa ácida posee un dominio homólogo a sus proteínas activadoras: las saposinas B y D". Protein Science . 3 (2): 359–61. doi :10.1002/pro.5560030219. PMC 2142785 . PMID  8003971. 
  4. ^ Tschopp J, Hofmann K (marzo de 1996). "Células T citotóxicas: ¿más armas para nuevos objetivos?". Trends in Microbiology . 4 (3): 91–4. doi :10.1016/0966-842X(96)81522-8. PMID  8868085.
  5. ^ ab Ponting CP, Russell RB (mayo de 1995). "Swaposinas: permutaciones circulares dentro de los genes que codifican homólogos de saposina". Tendencias en ciencias bioquímicas . 20 (5): 179–80. doi :10.1016/S0968-0004(00)89003-9. PMID  7610480.
  6. ^ Hawgood S, Derrick M, Poulain F (noviembre de 1998). "Estructura y propiedades de la proteína tensioactiva B". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Base molecular de la enfermedad . 1408 (2–3): 150–60. doi : 10.1016/S0925-4439(98)00064-7 . PMID  9813296.
  7. ^ Anderson DH, Sawaya MR, Cascio D, Ernst W, Modlin R, Krensky A, Eisenberg D (2003). "Estructura cristalina de la granulisina y un mecanismo lítico derivado de la estructura". J. Mol. Biol . 325 (2): 355–365. CiteSeerX 10.1.1.327.5540 . doi :10.1016/S0022-2836(02)01234-2. PMID  12488100. 
  8. ^ Staab JF, Ginkel DL, Rosenberg GB, Munford RS (1994). "Un dominio similar a la saposina influye en la localización intracelular, la estabilidad y la actividad catalítica de la aciloxiacilo hidrolasa humana". J. Biol. Chem . 269 (38): 23736–42. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31577-6 . PMID  8089145.

Lectura adicional

Enlaces externos

Este artículo incorpora texto de dominio público de Pfam e InterPro : IPR008138