El coeficiente de endogamia ( COI ) es un número que mide el grado de endogamia de un individuo. Específicamente, es la probabilidad de que dos alelos en cualquier locus de un individuo sean idénticos por descendencia de un ancestro común de los dos progenitores. [1] [2] [3] [4] Un COI más alto hará que los rasgos de la descendencia sean más predecibles, pero también aumenta el riesgo de problemas de salud. En la cría de perros, se recomienda mantener el COI por debajo del 5%; sin embargo, en algunas razas esto puede no ser posible sin el cruzamiento . [5]
Se dice que un individuo es consanguíneo si hay un bucle en su cuadro genealógico . Un bucle se define como un camino que va desde un individuo hasta el ancestro común a través de uno de los padres y de regreso al otro padre, sin pasar por ningún individuo dos veces. El número de bucles es siempre el número de ancestros comunes que tienen los padres. Si un individuo es consanguíneo, el coeficiente de endogamia se calcula sumando todas las probabilidades de que un individuo reciba el mismo alelo del lado paterno y del lado materno. Como cada individuo tiene una probabilidad del 50% de transmitir un alelo a la siguiente generación, la fórmula depende de 0,5 elevado a la potencia de las generaciones que separan al individuo del ancestro común de sus padres, tanto del lado paterno como del lado materno. Este número de generaciones se puede calcular contando cuántos individuos se encuentran en el bucle definido anteriormente. Por lo tanto, el coeficiente de endogamia (f) de un individuo X se puede calcular con la siguiente fórmula: [6] [1]
donde es el número de individuos en el bucle mencionado anteriormente, y es el coeficiente de endogamia del ancestro común de los padres de X.
Para dar un ejemplo, consideremos el siguiente pedigrí.
En este cuadro genealógico, G es la progenie de C y F, y C es el tío biológico de F. Para encontrar el coeficiente de endogamia de G, primero localice un bucle que conduzca desde G al ancestro común a través de un progenitor y de regreso al otro progenitor sin pasar por el mismo individuo dos veces. Solo hay dos bucles de este tipo en este cuadro, ya que solo hay 2 ancestros comunes de C y F. Los bucles son G - C - A - D - F y G - C - B - D - F, ambos con 5 miembros.
Como los ancestros comunes de los padres (A y B) no son endogámicos, . Por lo tanto, el coeficiente de endogamia del individuo G es .
Si los padres de un individuo no son consanguíneos, el coeficiente de consanguinidad del individuo es la mitad del coeficiente de parentesco entre los padres. Esto se puede verificar en el ejemplo anterior, ya que el 12,5% es la mitad del 25%, el coeficiente de parentesco entre un tío y una sobrina.
^A En este punto, los individuos se consideran parte de una cepa endogámica y cada individuo puede considerarse efectivamente como un clon .