El equipo de fútbol americano Iowa State Cyclones de 2006 representó a la Universidad Estatal de Iowa durante la temporada de fútbol americano FBS de la División I de la NCAA de 2006 . Jugaron sus partidos en casa en el estadio Jack Trice en Ames, Iowa . Participaron como miembros de la Conferencia Big 12 en la División Norte. Fueron entrenados por el entrenador en jefe Dan McCarney , quien estaba en su última temporada como entrenador en jefe de los Cyclones.
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