Embecovirus es un subgénero de coronavirus del género Betacoronavirus . [1] Los virus de este subgénero, a diferencia de otros coronavirus , tienen un gen de hemaglutinina esterasa (HE). [2] Los virus del subgénero se conocían anteriormente como coronavirus del grupo 2a . [3] [4]
Los virus de este subgénero, al igual que otros coronavirus, tienen una envoltura de bicapa lipídica en la que se anclan las proteínas estructurales de membrana (M), envoltura (E) y espícula (S) . [5] A diferencia de otros coronavirus, los virus de este subgénero también tienen una proteína estructural adicional más corta similar a una espícula llamada hemaglutinina esterasa (HE). [2] [6]
La recombinación genética puede ocurrir cuando dos o más genomas virales están presentes en la misma célula huésped. El beta-coronavirus del camello dromedario (Beta-CoV HKU23) exhibe diversidad genética en la población de camellos africanos . [7] Varios eventos de recombinación que tuvieron lugar en el pasado entre Beta-CoV estrechamente relacionados del subgénero Embecovirus contribuyen a esta diversidad. [7]
En todos los miembros del subgrupo A de Betacoronavirus, un gen de hemaglutinina esterasa (HE), que codifica una glicoproteína con actividad de O-acetil-esterasa neuraminato y el sitio activo FGDS, está presente corriente abajo de ORF1ab y corriente arriba del gen S (Figura 1).
Véase la figura 2.
Los CoV se clasifican en cuatro géneros, Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus y Deltacoronavirus. Dentro de Betacoronavirus, se pueden subclasificar en los linajes A, B, C y D [1]. En 2018, estos cuatro linajes fueron reclasificados como subgéneros de Betacoronavirus y renombrados como Embecovirus (linaje anterior A), Sarbecovirus (linaje anterior B), Merbecovirus (linaje anterior C) y Nobecovirus (linaje anterior D) [2]. Además, también se incluyó un quinto subgénero, Hibecovirus (Figura 1) [2].
La presencia de genes HE exclusivamente en miembros del subgrupo A de Betacoronavirus, pero no en miembros de los subgrupos B, C y D de Betacoronavirus sugirió que la recombinación probablemente había ocurrido en el ancestro de los miembros del subgrupo A de Betacoronavirus, después de divergir del ancestro de otros subgrupos de Betacoronavirus.