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Dominio proteico YceI

En biología molecular , el dominio proteico Yce-I es una supuesta proteína periplásmica . Esta entrada representa la proteína de unión a lípidos YceI de Escherichia coli [1] y la proteína de unión a poliisoprenoide TTHA0802 de Thermus thermophilus . [2] Su función es ayudar a la biosíntesis de isoprenoides , una molécula importante que se encuentra en todos los organismos vivos .

Estructura

Ambas proteínas comparten un dominio común con un pliegue de barril beta de 8 hebras . Esto se parece al pliegue de lipocalina , aunque no existe homología de secuencia con las lipocalinas. En TTHA0802, la proteína se une a la cadena de poliisoprenoide dentro del poro del barril a través de interacciones hidrofóbicas . [2] Los homólogos de secuencia de esta estructura central están presentes en una amplia gama de bacterias y arqueas .

Función

Las estructuras cristalinas sugieren que esta familia de proteínas desempeña un papel importante en el metabolismo de las isoprenoides quinonas o en su transporte o almacenamiento. En ambos casos, la proteína es un homodímero, y cada monómero se caracteriza por un pliegue de lipocalina. [2]

Referencias

  1. ^ Stancik LM, Stancik DM, Schmidt B, Barnhart DM, Yoncheva YN, Slonczewski JL (agosto de 2002). "Expresión dependiente del pH de proteínas periplásmicas y catabolismo de aminoácidos en Escherichia coli". J. Bacteriol . 184 (15): 4246–58. doi :10.1128/jb.184.15.4246-4258.2002. PMC  135203 . PMID  12107143.
  2. ^ abc Handa N, Terada T, Doi-Katayama Y, Hirota H, Tame JR, Park SY, Kuramitsu S, Shirouzu M, Yokoyama S (abril de 2005). "Estructura cristalina de una nueva proteína de unión a poliisoprenoide de Thermus thermophilus HB8". Protein Sci . 14 (4): 1004–10. doi :10.1110/ps.041183305. PMC 2253440 . PMID  15741337. 
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