El condado de Santa Ana fue uno de los siete partidos originales creados en Nuevo México bajo el dominio mexicano . Bajo el dominio estadounidense, se convirtió en un condado territorial de EE. UU. desde 1852 hasta 1876, cuando fue absorbido por el condado de Bernalillo . Hoy en día no existe como unidad administrativa. La sede original del condado de Santa Ana es lo que ahora es Fort Defiance, Arizona . El condado recibió su nombre del Pueblo de Santa Ana.
El área delimitada por el condado original de Santa Ana estuvo en el Distrito Judicial No. 1 desde 1847 hasta 1863, luego en el JD 2 hasta 1876, cuando fue absorbido por el condado de Bernalillo.