El UTR 5′ del Tombusvirus es una importante región cisreguladora del genoma del virus Tombus .
El virus del enanismo arbustivo del tomate es el miembro prototipo de la familia Tombusviridae . El genoma de este virus es ARN monocatenario de sentido positivo . La replicación se produce a través de un ARN intermediario de cadena negativa. Además de las proteínas virales p33 y la ARN polimerasa dependiente de ARN p92, y factores hospedadores desconocidos, las regiones conservadas y estructurales dentro de la región no traducida 5' (5' UTR) son importantes para regular la replicación del genoma. [ cita requerida ]
Se han descrito dos dominios de ARN en el UTR 5′: un dominio en forma de T (TSD) 5′ seguido de un dominio de tallo-bucle (SL5) [1] [2] y un dominio descendente (DSD). [3] Se propone que las interacciones TSD-DSD estén implicadas en la mediación de la replicación del ARN viral. [3]
Una característica interesante del Tombusvirus es su capacidad de favorecer la replicación de ARN interferentes defectuosos (DI). Estos replicones subvirales son pequeños mutantes no codificantes por deleción del genoma viral que mantienen elementos de ARN que actúan en cis y son necesarios para la replicación [1].
Otras estructuras de ARN no codificantes en Tombusvirus incluyen la región 3′ UTR IV [4] y un elemento de replicación interna . [5]
Referencias
- ^ ab Wu B, Vanti WB, White KA (2001). "Un dominio de ARN dentro de la región no traducida 5' del genoma del virus del enanismo arbustivo del tomate modula la replicación del ARN viral". J. Mol. Biol . 305 (4): 741–756. doi :10.1006/jmbi.2000.4298. PMID 11162089.
- ^ Ray D, Na H, White KA (2004). "Propiedades estructurales de un dominio de ARN multifuncional en forma de T que median la replicación eficiente del ARN del virus del enanismo arbustivo del tomate". J. Virol . 78 (19): 10490–10500. doi :10.1128/JVI.78.19.10490-10500.2004. PMC 516415 . PMID 15367615.
- ^ ab Ray D, Wu B, White KA (2003). "Un segundo dominio funcional de ARN en el UTR 5' del genoma del virus del enanismo arbustivo del tomate: interacciones intra e interdominios median la replicación viral del ARN". ARN . 9 (10): 1232–1245. doi :10.1261/rna.5630203. PMC 1370487 . PMID 13130137.
- ^ Fabian MR, Na H, Ray D, White KA (2003). "Las estructuras secundarias del ARN 3′-terminal son importantes para la acumulación de ARN DI del virus del enanismo arbustivo del tomate". Virology . 313 (2): 567–580. doi : 10.1016/S0042-6822(03)00349-0 . PMID 12954222.
- ^ Monkewich, S; Lin HX; Fabian MR; Xu W; Na H; Ray D; Chernysheva OA; Nagy PD; White KA (2005). "La región codificante de la polimerasa p92 contiene un elemento de ARN interno requerido en un paso temprano en la replicación del genoma del virus Tombus". J Virol . 79 (8): 4848–4858. doi :10.1128/JVI.79.8.4848-4858.2005. PMC 1069561 . PMID 15795270.
Enlaces externos
- Página de Tombusvirus 5′ UTR en Rfam
