La ecología inversa se refiere al uso de la genómica para estudiar la ecología sin suposiciones a priori sobre el organismo u organismos en consideración. El término fue sugerido en 2007 por Matthew Rockman durante una conferencia sobre genómica ecológica en Christchurch , Nueva Zelanda. [1] Rockman estaba haciendo una analogía con el término genética inversa en el que la función de un gen se estudia comparando los efectos fenotípicos de diferentes secuencias genéticas de ese gen. La mayoría de los investigadores que emplean la ecología inversa hacen uso de algún tipo de metodología de genómica de poblaciones . Esto requiere que se realice un escaneo del genoma en múltiples individuos de al menos dos poblaciones para identificar regiones o sitios genómicos que muestren signos de selección. Estos escaneos del genoma generalmente utilizan marcadores de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) , aunque el uso de microsatélites también puede funcionar (con una resolución reducida).
Los investigadores han utilizado la ecología inversa para comprender los entornos y otros rasgos ecológicos de los organismos de la Tierra mediante enfoques genómicos. Al examinar los genes de las bacterias , los científicos pueden reconstruir cómo son los entornos de los organismos en la actualidad, o incluso hace millones de años. Los datos podrían ayudarnos a comprender eventos clave en la historia de la vida en la Tierra. En 2010, los investigadores presentaron una técnica para llevar a cabo la ecología inversa para inferir las condiciones de rango de temperatura de vida de una bacteria en función del contenido de GC de ciertas regiones genómicas. [2]
En 2011, investigadores de la Universidad de California en Berkeley pudieron demostrar que se pueden determinar los rasgos adaptativos de un organismo observando primero su genoma y comprobando si existen variaciones en una población. [3]