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Dominio KilA-N

En biología molecular, el dominio KilA-N es un dominio de unión al ADN conservado que se encuentra en el extremo N de las proteínas D6R/NIR del poxvirus . También se encuentra en una amplia gama de proteínas de grandes virus de ADN bacterianos y eucariotas . [1] También se han identificado supuestas proteínas con homología con el dominio KilA-N en elementos transponibles Maverick del protozoo parabasalid Trichomonas vaginalis . [2] Se ha sugerido que el dominio KilA-N es homólogo al dominio APSES de unión al ADN del hongo . En todas las proteínas que se ha demostrado que contienen el dominio KilA-N, éste se produce en el extremo amino terminal acompañado de una amplia gama de dominios carboxi terminales distintos . Estos módulos carboxi-terminales pueden ser enzimas , como los dominios de nucleasa , o pueden mediar interacciones específicas adicionales con ácidos nucleicos o proteínas, como los dedos RING o CCCH en los poxvirus . [1] Se predice que el dominio KilA-N adoptará un pliegue alfa-beta con cuatro hebras conservadas y al menos dos hélices conservadas . [1] Algunas proteínas que se sabe que contienen un dominio KilA-N se enumeran a continuación:

Referencias

  1. ^ abc Iyer LM, Koonin EV, Aravind L (2002). "Amplia mezcla de dominios en reguladores de transcripción de virus de ADN e implicaciones para el origen de los factores de transcripción APSES fúngicos". Genoma Biol . 3 (3): INVESTIGACIÓN0012. doi : 10.1186/gb-2002-3-3-research0012 . PMC  88810 . PMID  11897024.
  2. ^ Pritham EJ, Putliwala T, Feschotte C (abril de 2007). "Mavericks, una nueva clase de elementos transponibles gigantes muy extendidos en eucariotas y relacionados con los virus de ADN". Gen.390 (1–2): 3–17. doi :10.1016/j.gene.2006.08.008. PMID  17034960.
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