La fase eliminatoria de la Copa de la UEFA 2006-07 comenzó el 14 de febrero de 2007 y culminó con la final en Hampden Park , Glasgow , el 16 de mayo de 2007. La fase eliminatoria incluyó a los tres mejores equipos de cada grupo en la fase anterior y a los terceros clasificados de la fase de grupos de la Liga de Campeones de la UEFA 2006-07 .
Cada eliminatoria de la ronda eliminatoria consistió en partidos de ida y vuelta, de ida y vuelta, en los que el equipo con mayor puntuación global avanzaba a la siguiente ronda, con excepción de la final, que se disputó a un solo partido en una cancha neutral. En caso de empate en la puntuación global de los dos equipos, el equipo que anotó más goles en su partido de ida pasaba a la siguiente ronda.
Los partidos de ida se celebraron el 14 y el 15 de febrero de 2007, mientras que los de vuelta se celebraron el 22 de febrero de 2007.
1 El 7 de febrero, el gobierno italiano dictaminó que los campos de juego de Parma y Livorno no cumplían con los requisitos de seguridad tras los disturbios que se produjeron tras un partido de la Serie A en Sicilia . Ambos equipos jugaron sus partidos de local a puerta cerrada.
El 19 de enero, la UEFA declaró que el Feyenoord había sido descalificado tras el mal comportamiento de su público en su último partido de la fase de grupos contra el Nancy . El 25 de enero, la UEFA anunció que el Tottenham Hotspur había quedado exento. Esto se confirmó tras una última apelación.
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El AZ ganó por el valor doble de los goles marcados fuera de casa. El resultado global fue 5-5.
El Maccabi Haifa ganó 1-0 en el global.
El Bayer Leverkusen ganó 3-2 en el global.
El Shakhtar Donetsk ganó 2-1 en el global.
El Benfica ganó 3-1 en el global.
El Celta de Vigo ganó 3-2 en el global.
El Newcastle United ganó 4-1 en el global.
Osasuna ganó 1-0 en el global.
El Lens ganó 3-1 en el global.
El Paris Saint-Germain ganó 4-0 en el global.
Braga ganó 2-0 en el global.
El Sevilla ganó 3-0 en el global.
El Werder Bremen ganó 4-3 en el global.
Los Rangers ganaron 5-2 en el global.
El Espanyol ganó 4-1 en el global.
Adiós: Tottenham Hotspur
Los partidos de ida se celebraron el 8 de marzo de 2007, mientras que los de vuelta se celebraron el 14 y 15 de marzo de 2007.
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El Bayer Leverkusen ganó 4-2 en el global.
Osasuna ganó 2-1 en el global.
El Werder Bremen ganó 3-0 en el global.
El Tottenham Hotspur ganó 6-4 en el global.
El Sevilla ganó 5-4 en el global.
El AZ ganó por el valor doble de los goles marcados fuera de casa. El resultado global fue 4-4.
El Espanyol ganó 4-0 en el global.
El Benfica ganó 4-3 en el global.
El sorteo de las fases finales, que incluían cuartos de final y semifinales, se celebró el 16 de marzo de 2007 en Glasgow ( Escocia) . Los partidos de cuartos de final se jugaron el 5 y el 12 de abril de 2007.
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El Espanyol ganó 3-2 en el global.
Osasuna ganó 4-0 en el global.
El Sevilla ganó 4-3 en el global.
El Werder Bremen ganó 4-1 en el global.
Los partidos de semifinales se jugaron el 26 de abril y el 3 de mayo de 2007.
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El Sevilla ganó 2-1 en el global.
El Espanyol ganó 5-1 en el global.
La final se jugó el 16 de mayo de 2008 en Hampden Park en Glasgow , Escocia.