Un gráfico de Manhattan es un tipo de gráfico que generalmente se utiliza para mostrar datos con una gran cantidad de puntos de datos, muchos de ellos de amplitud distinta de cero y con una distribución de valores de mayor magnitud. El gráfico se utiliza comúnmente en estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) para mostrar SNP significativos . [1]
Obtiene su nombre de la similitud de dicho terreno con el horizonte de Manhattan : un perfil de rascacielos que se elevan sobre los "edificios" del nivel inferior que varían en torno a una altura más baja.
En los gráficos de Manhattan de GWAS, las coordenadas genómicas se muestran a lo largo del eje x , con el logaritmo negativo del valor p de asociación para cada polimorfismo de nucleótido único (SNP) mostrado en el eje y , lo que significa que cada punto en el gráfico de Manhattan significa un SNP. Debido a que las asociaciones más fuertes tienen los valores p más pequeños (por ejemplo, 10 −15 ), sus logaritmos negativos serán los mayores (por ejemplo, 15). Los diferentes colores de cada bloque suelen mostrar la extensión de cada cromosoma.
