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Nudo de cistina

Un nudo de cistina es un motivo estructural proteico que contiene tres puentes disulfuro (formados a partir de pares de residuos de cisteína ). Las secciones de polipéptido que se encuentran entre dos de ellos forman un bucle a través del cual pasa un tercer enlace disulfuro, formando una subestructura de rotaxano . El motivo del nudo de cistina estabiliza la estructura proteica y se conserva en proteínas de diversas especies. [2] [3] [4] Existen tres tipos de nudo de cistina, que difieren en la topología de los enlaces disulfuro: [5]

El nudo de cistina del factor de crecimiento se observó por primera vez en la estructura del factor de crecimiento nervioso (NGF), resuelto por cristalografía de rayos X y publicado en 1991 por Tom Blundell en Nature . [6] El GFCK está presente en cuatro superfamilias. Estas incluyen el factor de crecimiento nervioso, el factor de crecimiento transformante beta (TGF-β), el factor de crecimiento derivado de plaquetas y las hormonas glicoproteicas , incluida la gonadotropina coriónica humana . Estos están relacionados estructuralmente debido a la presencia del motivo del nudo de cistina, pero difieren en la secuencia. [7] Todas las estructuras de GFCK que se han determinado son diméricas, pero sus modos de dimerización en diferentes clases son diferentes. [8] La subfamilia del factor de crecimiento endotelial vascular , categorizada como parte de la superfamilia del factor de crecimiento derivado de plaquetas, incluye proteínas que son factores angiogénicos . [9]

La presencia del motivo del nudo de cistina cíclico (CCK) se descubrió cuando se aislaron ciclótidos de varias familias de plantas. El motivo CCK tiene una estructura principal cíclica, una lámina beta de triple cadena y una conformación de nudo de cistina. [10]

Se están añadiendo nuevas proteínas a la familia de motivos de nudos de cistina, también conocidas como proteínas de nudos de cistina C-terminales (CTCK). Comparten aproximadamente 90 residuos de aminoácidos en sus regiones C-terminales ricas en cisteína. [9]

El nudo de cistina inhibidor (ICK) es un motivo estructural con una lámina beta antiparalela de triple cadena unida por tres enlaces disulfuro, formando un núcleo anudado. El motivo ICK se puede encontrar en la categoría de filo , como animales y plantas. A menudo se encuentra en muchos péptidos de veneno como los de caracoles, arañas y escorpiones. El péptido K-PVIIA, que contiene un ICK, puede experimentar una ciclización exitosa de la cadena principal enzimática . La conectividad disulfuro y el patrón de secuencia común del motivo ICK proporciona la estabilidad de los péptidos que apoyan la ciclización. [11]

Implicaciones de los medicamentos

La estabilidad y la estructura del motivo del nudo de cistina implican posibles aplicaciones en el diseño de fármacos . La unión de hidrógeno entre los enlaces disulfuro del motivo y las estructuras de lámina beta da lugar a una estabilización de la estructura altamente eficiente. Además, el tamaño del motivo es de aproximadamente 30 residuos de aminoácidos. [12] Estas dos características lo convierten en una biomolécula atractiva para ser utilizada para la administración de fármacos, ya que exhibe estabilidad térmica, estabilidad química y resistencia proteolítica. Las actividades biológicas de estas moléculas se deben parcialmente a la disposición entrelazada única y al esqueleto peptídico ciclado que contiene una secuencia conservada compartida entre las circulinas. [12] Las circulinas se han identificado previamente en una prueba de actividad anti-VIH. [13] Los estudios han demostrado que las proteínas del nudo de cistina se pueden incubar a temperaturas de 65 °C o colocar en 1 N HCl/1 N NaOH sin pérdida de integridad estructural y funcional. [14] Su resistencia a las proteasas orales y algunas intestinales sugiere un posible uso para la administración oral. Las posibles aplicaciones futuras incluyen el alivio del dolor, así como funciones antivirales y antibacterianas. [14]

Referencias

  1. ^ Wu H, Lustbader JW, Liu Y, Canfield RE, Hendrickson WA (junio de 1994). "Estructura de la gonadotropina coriónica humana con una resolución de 2,6 A a partir del análisis MAD de la proteína selenometionil". Estructura . 2 (6): 545–58. doi :10.1016/s0969-2126(00)00054-x. PMID  7922031.
  2. ^ "Nudos de cistina". La página web de Cyclotide . Archivado desde el original el 5 de febrero de 2015. Consultado el 24 de abril de 2019 .
  3. ^ Sherbet, GV (2011), "Familias de factores de crecimiento", Factores de crecimiento y sus receptores en la diferenciación celular, cáncer y terapia del cáncer , Elsevier, págs. 3-5, doi :10.1016/b978-0-12-387819-9.00002-5, ISBN 9780123878199, consultado el 1 de mayo de 2019
  4. ^ Vitt, Ursula A.; Hsu, Sheau Y.; Hsueh, Aaron JW (1 de mayo de 2001). "Evolución y clasificación de hormonas que contienen nudos de cistina y moléculas de señalización extracelular relacionadas". Endocrinología molecular . 15 (5): 681–694. doi : 10.1210/mend.15.5.0639 . ISSN  0888-8809. PMID  11328851.
  5. ^ Daly NL, Craik DJ (junio de 2011). "Proteínas de nudo de cistina bioactivas". Current Opinion in Chemical Biology . 15 (3): 362–8. doi :10.1016/j.cbpa.2011.02.008. PMID  21362584.
  6. ^ PDB : 1bet ​; McDonald NQ, Lapatto R, Murray-Rust J, Gunning J, Wlodawer A, Blundell TL (diciembre de 1991). "Nuevo pliegue proteico revelado por una estructura cristalina de resolución 2,3-A del factor de crecimiento nervioso". Nature . 354 (6352): 411–4. Bibcode :1991Natur.354..411M. doi :10.1038/354411a0. PMID  1956407. S2CID  4346788.
  7. ^ Sun PD, Davies DR (1995). "La superfamilia del factor de crecimiento del nudo de cistina". Revisión anual de biofísica y estructura biomolecular . 24 (1): 269–91. doi :10.1146/annurev.bb.24.060195.001413. PMID  7663117.
  8. ^ Jiang X, Dias JA, He X (enero de 2014). "Biología estructural de las hormonas glicoproteicas y sus receptores: perspectivas sobre la señalización". Endocrinología molecular y celular . 382 (1): 424–451. doi : 10.1016/j.mce.2013.08.021 . PMID  24001578.
  9. ^ ab Iyer S, Acharya KR (noviembre de 2011). "Atando cabos: la firma de cistina y los procesos de reconocimiento molecular de la familia de factores de crecimiento endotelial vascular de citocinas angiogénicas". The FEBS Journal . 278 (22): 4304–22. doi :10.1111/j.1742-4658.2011.08350.x. PMC 3328748 . PMID  21917115. 
  10. ^ Craik DJ, Daly NL, Bond T, Waine C (diciembre de 1999). "Ciclótidos vegetales: una familia única de proteínas cíclicas y anudadas que define el motivo estructural del nudo de cistina cíclico". Journal of Molecular Biology . 294 (5): 1327–36. doi :10.1006/jmbi.1999.3383. PMID  10600388.
  11. ^ Kwon, Soohyun; Bosmans, Frank; Kaas, Quentin; Cheneval, Oliver; Cinibear, Anne C; Rosengren, K Johan; Wang, Conan K; Schroeder, Christina I; Craik, David J (19 de abril de 2016). "Ciclización enzimática eficiente de un péptido inhibidor que contiene nudos de cistina". Biotecnología y bioingeniería . 113 (10): 2202–2212. doi :10.1002/bit.25993. PMC 5526200 . PMID  27093300. 
  12. ^ ab Kolmar, Harald. “Diversidad biológica y potencial terapéutico de las miniproteínas de nudo de cistina naturales y diseñadas”. Current Opinion in Pharmacology, vol. 9, núm. 5, 2009, págs. 608–614, doi:10.1016/j.coph.2009.05.004.
  13. ^ KR Gustafson, RC Sowder II, LE Henderson, IC Parsons, Y. Kashman, JH Cardellina II, JB McMahon, RW Buckheit Jr., LK Pannell, MR Boyd Circulinas A y B: nuevos péptidos macrocíclicos inhibidores del VIH del árbol tropical Chassalia parvifolia J. Am. Chem. Soc., 116 (1994), págs. 9337-9338
  14. ^ ab Craik, David J., et al. “El motivo del nudo de cistina en las toxinas y sus implicaciones para el diseño de fármacos”. Toxicon, vol. 39, núm. 1, 2001, págs. 43–60, doi:10.1016/s0041-0101(00)00160-4.