El UCI Africa Tour 2005-06 fue la segunda temporada del UCI Africa Tour . La temporada comenzó el 26 de octubre de 2005 con el Tour du Faso y finalizó el 17 de septiembre de 2006 con el Tour du Sénégal .
El líder en puntos, según los resultados acumulados de las carreras anteriores, viste el maillot ciclista del UCI Africa Tour . Tiaan Kannemeyer de Sudáfrica fue el campeón defensor del UCI Africa Tour 2005. Rabaki Jérémie Ouédraogo de Burkina Faso fue coronado campeón del UCI Africa Tour 2005-06.
A lo largo de la temporada, se otorgan puntos a los primeros clasificados de las etapas dentro de las carreras por etapas y a la clasificación general final de cada una de las carreras por etapas y eventos de un día. La calidad y la complejidad de una carrera también determinan cuántos puntos se otorgan a los primeros clasificados; cuanto más alta sea la clasificación UCI de una carrera, más puntos se otorgan. Las clasificaciones UCI de mayor a menor son las siguientes: