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Revista de biología celular

The Journal of Cell Biology es una revista científica revisada por pares publicada por Rockefeller University Press .

Historia

A principios de la década de 1950, un pequeño grupo de biólogos comenzó a explorar la anatomía intracelular utilizando la tecnología emergente de la microscopía electrónica . Muchos de estos investigadores trabajaban en el Instituto de Medicina Rockefeller, predecesor de la Universidad Rockefeller . A medida que su trabajo avanzaba hacia la publicación, se sintieron decepcionados por la calidad limitada de la reproducción de imágenes en semitonos en las revistas impresas de la época y frustrados por las estrechas políticas editoriales de las revistas existentes con respecto a sus resultados basados ​​en imágenes. En 1954, el director del Instituto Rockefeller, Detlev Bronk , convocó un almuerzo para discutir la creación de una nueva revista como lugar para la publicación de este tipo de trabajo. [1]

El primer número de The Journal of Biophysical and Biochemical Cytology se publicó menos de un año después, el 25 de enero de 1955. La suscripción costaba 15 dólares al año. La lista de editores estaba formada por Richard S. Bear, H. Stanley Bennett, Albert L. Lehninger , George E. Palade , Keith R. Porter , Francis O. Schmitt , Franz Schrader y Arnold M. Seligman. Las instrucciones para los autores describían el alcance de la revista: " The Journal of Biophysical and Biochemical Cytology está diseñada para proporcionar un medio común para la publicación de investigaciones morfológicas , biofísicas y bioquímicas sobre las células, sus componentes y sus productos. Prestará especial atención a los informes sobre la organización celular a nivel coloidal y molecular y a los estudios que integren información citológica derivada de varios enfoques técnicos". Reconociendo que necesitaban un título más llamativo, los editores cambiaron el nombre a The Journal of Cell Biology ("JCB") en 1962.

Se han publicado muchos descubrimientos seminales en la revista, incluidas las primeras descripciones de numerosas funciones y estructuras celulares, como la vía secretora , [2] [3] [4] [5] [6] [7] el ADN mitocondrial [8] [9] y del cloroplasto [10] , los microtúbulos , [11] [12] los filamentos intermedios , [13] las uniones estrechas [14] (incluidas las ocludinas [15] y las claudinas [16] ), las uniones adherentes , [14] y las cadherinas . [17]

Fechas clave

Resumen e indexación

Según Journal Citation Reports , la revista tiene un factor de impacto de 8,077 en 2021, lo que la sitúa en el puesto 28 entre 201 revistas en la categoría "Biología celular". [20]

Acceso en línea

La revista se publicó por primera vez en línea el 13 de enero de 1997. Durante ese primer año de publicación en línea, todo el contenido fue de acceso gratuito para el público. En enero de 1998, todo el contenido de investigación primaria se colocó bajo controles de acceso, pero todo el contenido de noticias y reseñas siguió siendo gratuito para el público inmediatamente después de su publicación.

En enero de 2001, en respuesta a los pedidos de la comunidad investigadora de proporcionar acceso gratuito a los resultados de las investigaciones financiadas con fondos públicos, la revista fue una de las primeras en publicar su contenido de investigación principal seis meses después de su publicación. [21]

En junio de 2003, todo el contenido, a partir del volumen 1, número 1, se publicó en línea y se proporcionó de forma gratuita. [22]

En noviembre de 2007, en previsión del mandato de los Institutos Nacionales de Salud sobre el acceso público a los resultados de las investigaciones financiadas por los NIH, la revista comenzó a depositar todo su contenido en PubMed Central , donde la versión final publicada se publica al público 6 meses después de su publicación. [23]

Derechos de autor y uso por parte de terceros

En julio de 2000, la revista fue una de las primeras [ cita requerida ] en permitir a los autores publicar el archivo pdf final de sus artículos en sus propios sitios web. [ 24 ] El 1 de mayo de 2008, se modificó la política de derechos de autor , lo que permitió a los autores conservar los derechos de autor de sus propias obras. Al mismo tiempo, el contenido de la revista se abrió al uso de terceros bajo una licencia Creative Commons . [ cita requerida ] La única restricción para este uso por parte de terceros es que no pueden crear un sitio espejo gratuito dentro de los primeros seis meses posteriores a la publicación.

Integridad de los datos

Orígenes del cribado de imágenes

En 2002, la revista adoptó un flujo de trabajo de producción completamente electrónico. Esto significa que todo el texto se envía como archivos de documentos electrónicos y todas las figuras se envían como archivos de imágenes electrónicos. Mientras formateaba los archivos de figuras para un manuscrito aceptado, Mike Rossner , que entonces era el editor en jefe , descubrió un Western blot en el que la intensidad de una sola banda se había ajustado selectivamente en relación con las otras bandas. Los datos originales se obtuvieron de los autores y era evidente que la manipulación afectó la interpretación de los datos. La aceptación editorial del manuscrito fue revocada y la revista inició inmediatamente una política para examinar todas las imágenes en todos los artículos aceptados en busca de evidencia de manipulación de imágenes. [25]

Pautas para el manejo de imágenes digitales

En consulta con científicos en ejercicio del consejo editorial , se desarrollaron directrices para el manejo de imágenes digitales, que se publicaron por primera vez en junio de 2003. [26]

Publicidad sobre manipulación y filtrado de imágenes

El programa de cribado de imágenes de la revista se publicitó en un artículo en Nature en abril de 2005, titulado "CSI Cell Biology". [27] El día de Navidad de 2005, The New York Times publicó un artículo que mostraba que la manipulación de imágenes era parte del fraude científico perpetrado por Hwang Woo-Suk y colegas. [28] Cuando se hizo evidente que el programa de cribado del Journal of Cell Biology habría detectado la manipulación de imágenes antes de la publicación, el New York Times destacó el proceso de la revista en la portada de su sección Science Times el 24 de enero de 2006. [29] Esto aumentó la conciencia entre el público y entre otras revistas biomédicas sobre el valor potencial del cribado de imágenes por parte de los editores de revistas.

Respuesta de la Academia Nacional de Ciencias

En febrero de 2006, los editores expresaron la necesidad de contar con estándares aprobados por la comunidad para mantener la integridad de los datos en una carta al presidente de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos, Ralph Cicerone . [30] La carta, junto con las preocupaciones posteriores sobre los datos digitales planteadas por otros editores científicos, proporcionó el impulso para un estudio del Comité de Ciencia, Ingeniería y Política Pública (una unidad conjunta de la academia, la Academia Nacional de Ingeniería y el Instituto de Medicina ) para examinar la cuestión de la integridad de los datos. El estudio se encargó en mayo de 2006. [ cita requerida ]

Mike Rossner presentó una charla al Comité en una reunión abierta en abril de 2007, en la que describió la experiencia de JCB y otras revistas de Rockefeller University Press en el manejo de la manipulación de imágenes. Señaló que debería ser responsabilidad de la comunidad de investigación desarrollar estándares de integridad de datos, pero JCB había asumido esa función porque no existían tales estándares cuando JCB afrontó el problema por primera vez en 2002.

El Comité publicó su informe, titulado "Garantizar la integridad, la accesibilidad y la administración de los datos de investigación en la era digital", en julio de 2009. [31] El anuncio de la NAS citó específicamente a JCB por sus medidas proactivas para establecer directrices específicas sobre "formas aceptables e inaceptables de alterar imágenes". El informe abordó el problema de la integridad de los datos desde la perspectiva de la verdad y la precisión en la adquisición y la presentación de los datos, y desde la perspectiva de la accesibilidad de los datos a lo largo del tiempo. No proporcionó normas específicas para mantener la integridad de los datos ni recomendaciones para hacer cumplir esas normas una vez establecidas. El informe llegó a la amplia conclusión de que "los propios investigadores son responsables de garantizar la integridad de sus datos de investigación".

Innovaciones técnicas

El estándar RGB

JCB fue la primera revista en adoptar el "estándar RGB" para la reproducción de imágenes en color. Para maximizar la calidad de la reproducción de imágenes en color, JCB declaró en enero de 2004 [32] que la versión en línea de la revista es la "revista de registro" y que las imágenes se reproducirían en línea utilizando los archivos de los autores en el mismo esquema de color (rojo, verde, azul) en el que se adquieren con cámaras digitales y que se utiliza para mostrarlas en un monitor de computadora.

Anteriormente, se pedía a los autores que convirtieran sus archivos RGB al esquema de color CMYK necesario para la impresión en papel, lo que provocaba una pérdida sustancial del brillo de la imagen. Luego, el editor convertía esos archivos CMYK de nuevo a RGB para publicarlos en línea, lo que daba lugar a una segunda ronda de alteraciones de los colores originales. La llegada del flujo de trabajo RGB permitió que los colores se mostraran en la publicación en línea exactamente como aparecían en los archivos originales de los autores.

El visor de datos de JCB

El 1 de diciembre de 2008, JCB lanzó JCB DataViewer, la primera aplicación basada en navegador para visualizar datos de imágenes originales y multidimensionales. [33] Esta aplicación se creó en conjunto con Glencoe Software [34] utilizando un motor de gestión de datos basado en el software OMERO desarrollado por Open Microscopy Environment. [35] Glencoe Software también desarrolló una aplicación "Rollup" para cargar archivos de imágenes originales en DataViewer. DataViewer admite numerosos tipos de archivos propietarios de varios microscopios y sistemas de documentación de geles. [36]

Esta revolucionaria aplicación permite a los autores de JCB presentar datos de imágenes multidimensionales tal como fueron adquiridos, lo que les da la oportunidad de compartir datos que antes no era posible compartir. Los lectores de JCB pueden ver datos originales que respaldan un artículo publicado y pueden interactuar con esos datos desplazándose por una pila z o una pila de imágenes con lapso de tiempo. Los usuarios pueden seleccionar canales individuales para verlos o ver todos los canales por separado en la misma pantalla. También pueden producir gráficos de líneas de intensidades de píxeles a lo largo de cualquier eje horizontal o vertical.

Una actualización del software en agosto de 2012 permite al usuario pasar sin problemas de un aumento de 1 milímetro a un micrómetro de imágenes obtenidas a partir de microscopios ópticos y electrónicos. Por ejemplo, proporcionan una imagen completa de un embrión de pez cebra. [37] [38]

Referencias

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Enlaces externos