El Instituto de Investigación de Energía Atómica de Japón ( en japonés :日本原子力研究所) ( JAERI ) es una antigua organización semigubernamental que existía con el propósito de promover la energía nuclear en Japón. Fue creado en junio de 1956 por la Ley Básica de Energía Atómica . Se fusionó con el Instituto de Desarrollo del Ciclo Nuclear de Japón y se convirtió en la Agencia de Energía Atómica de Japón el 1 de octubre de 2005, que actualmente lleva a cabo el propósito descrito en la ley. Se llamaba Genken (原研) para abreviar.
En 1955, un pequeño número de investigadores japoneses estudiaron en el Laboratorio Nacional Argonne de Estados Unidos con el objetivo de adquirir conocimientos que pudieran llevarse a Japón. Kinichi Torikai fue uno de esos investigadores y más tarde se convirtió en presidente de JAERI. Después de regresar, se establecieron instalaciones para la investigación nuclear en Tōkai, Ibaraki .
En la década de 1950, se decidió que las empresas eléctricas individuales importarían tipos de reactores para satisfacer la creciente demanda de energía en el Japón de la posguerra. En septiembre de 1955, se estableció JAERI como fundación jurídica. En mayo de 1956, se estableció como corporación semigubernamental. Para asegurar también el combustible nuclear, también se creó Nuclear Fuel Industries. La construcción de nuevas plantas comenzó poco después y la primera de ellas, la planta de energía nuclear de Tōkai , comenzó a funcionar en 1966.