Primera División de México Apertura 2006 fue la edición 2006 de La Primera División del Futbol Mexicano , coronando al campeón de fútbol de otoño de México. La temporada se desarrolló del 5 de agosto al 10 de diciembre de 2006. Querétaro ascendió a la Primera División de México por lo que Dorados descendió a la Primera División A. Guadalajara ganó el campeonato por undécima vez, un récord, clasificándose para la Copa de Campeones de CONCACAF 2007 .
Los jugadores aparecen ordenados primero por los goles marcados y luego por el apellido. Solo se muestran los goles de la temporada regular.
Fuente: Medio Tiempo
Toluca ganó 2-1 en el global.
Guadalajara ganó 6-1 en el global.
Toluca ganó 2-1 en el global.
Pachuca ganó 2-1 en el global.
América ganó 6-4 en total.
Guadalajara ganó 4-2 en el global.
Toluca ganó 2-1 en el global.
Guadalajara ganó 2-0 en el global.
Guadalajara ganó 3-2 en el global.