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Centro de peptidil transferasa

El centro de la peptidil transferasa ( EC 2.3.2.12) es una ribozima aminoaciltransferasa (enzima ARN) ubicada en la subunidad grande del ribosoma . Forma enlaces peptídicos entre aminoácidos adyacentes durante el proceso de traducción de la biosíntesis de proteínas . [1] También es responsable de la hidrólisis del peptidil-ARNt, lo que permite la liberación de la cadena peptídica sintetizada al final de la traducción. [2] La actividad de la peptidil transferasa no está mediada por ninguna proteína ribosomal, sino completamente por el ARN ribosomal (ARNr). El centro de la peptidil transferasa es una pieza significativa de evidencia que apoya la hipótesis del mundo del ARN . [2]

En los procariotas , la subunidad ribosómica 50S ( componente 23S ) contiene el centro de la peptidil transferasa y actúa como ribozima. El centro de la peptidil transferasa de la subunidad 50S se encuentra en las puntas inferiores (extremos aceptores) de los ARNt de los sitios A y P. [3] : 1062 

En los eucariotas , la subunidad ribosomal 60S ( componente 28S ) contiene el centro de la peptidil transferasa y actúa como ribozima.

Las peptidil transferasas no se limitan a la traducción, pero hay relativamente pocas enzimas con esta función. [ cita requerida ]

Mecanismo

Los sustratos para la reacción de la peptidil transferasa son dos moléculas de ARNt : una en el sitio peptidilo , que lleva la cadena peptídica en crecimiento, y la otra en el sitio aminoacilo , que lleva el aminoácido que se agregará a la cadena. La cadena peptidilo y el aminoácido entrante están unidos a sus respectivos ARNt a través de enlaces éster al átomo de oxígeno en los extremos 3' de estos ARNt. [3] : 437–8  Los extremos 3' de todos los ARNt comparten una secuencia CCA universalmente conservada. [4] La alineación entre los extremos CCA del ARNt peptidilo unido al ribosoma y el ARNt aminoacilo en el centro de la peptidil transferasa contribuye a la formación del enlace peptídico al proporcionar la orientación adecuada para que ocurra la reacción. [5] Esta reacción ocurre a través del desplazamiento nucleofílico. El grupo amino del ARNt aminoacilo ataca al grupo carbonilo terminal del ARNt peptidilo. La reacción procede a través de un intermedio tetraédrico y la pérdida del ARNt del sitio P como grupo saliente. [2]

En la hidrólisis del peptidil-ARNt se utiliza el mismo mecanismo, pero con una molécula de agua como nucleófilo. [2]

Inhibidores de antibióticos

Los siguientes inhibidores de la síntesis de proteínas se dirigen al centro de la peptidil transferasa:

Véase también

Referencias

  1. ^ Tirumalai MR, Rivas M, Tran Q, Fox GE (diciembre de 2021). "El centro de la peptidil transferasa: una ventana al pasado". Microbiology and Molecular Biology Reviews . 85 (4): e0010421. doi :10.1128/MMBR.00104-21. PMC  8579967 . PMID  34756086.
  2. ^ abcd Polacek N, Mankin AS (enero de 2005). "El centro de la peptidil transferasa ribosomal: estructura, función, evolución, inhibición". Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology . 40 (5): 285–311. doi :10.1080/10409230500326334. PMID  16257828.
  3. ^ de Garrett RH, Grisham CM (2012). Bioquímica (quinta edición). Belmont CA: Brooks/Cole. ISBN 978-1-133-10629-6.
  4. ^ Hou YM (abril de 2010). "Adición de CCA al ARNt: implicaciones para el control de calidad del ARNt". IUBMB Life . 62 (4): 251–260. doi :10.1002/iub.301. PMC 2848691 . PMID  20101632. 
  5. ^ Moore PB, Steitz TA (febrero de 2003). "Después de las estructuras de los ribosomas: ¿cómo funciona la peptidil transferasa?". ARN . 9 (2): 155–159. doi :10.1261/rna.2127103. PMC 1370378 . PMID  12554855. 
  6. ^ Gu Z, Harrod R, Rogers EJ, Lovett PS (junio de 1994). "Péptidos líderes anti-peptidil transferasa de genes de resistencia al cloranfenicol regulados por atenuación". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 91 (12): 5612–5616. Bibcode :1994PNAS...91.5612G. doi : 10.1073/pnas.91.12.5612 . PMC 44046 . PMID  7515506. 
  7. ^ Long KS, Hansen LH, Jakobsen L, Vester B (abril de 2006). "Interacción de los derivados de pleuromutilina con el centro de la peptidil transferasa ribosómica". Agentes antimicrobianos y quimioterapia . 50 (4): 1458–1462. doi :10.1128/AAC.50.4.1458-1462.2006. PMC 1426994. PMID  16569865 . 
  8. ^ Kaiser G. "Inhibidores de la síntesis de proteínas: animación del mecanismo de acción de los macrólidos. Clasificación de los agentes". Pharmamotion . The Community College of Baltimore County. Archivado desde el original el 26 de diciembre de 2008 . Consultado el 31 de julio de 2009 .

Enlaces externos