ARNm subgenómico

Los ARNm subgenómicos son esencialmente secciones más pequeñas de la cadena plantilla transcrita original .

ADN o ARN de 3' a 5'

Durante la transcripción , la cadena plantilla original generalmente se lee desde el extremo 3' al 5' de principio a fin. Los ARNm subgenómicos se crean cuando la transcripción comienza en el extremo 3' de la cadena plantilla (o 5' de la plantilla que se va a sintetizar recientemente) y comienza a copiarse hacia el extremo 5' de la cadena plantilla antes de "saltar" al final. de la plantilla y copiando los últimos nucleótidos del extremo 5' de la plantilla (terminando la cola 3' de la hebra recién creada).

Como resultado, la cadena traducida tendrá un extremo 5' similar en diversos grados a la plantilla original (dependiendo de qué parte de la plantilla saltó la transcripción) y un extremo 3' similar a la plantilla. ^[1]

ARN viral de 5' a 3' (sentido positivo)

El ARN viral de sentido positivo (5' a 3'), que puede traducirse directamente en las proteínas virales deseadas, pasa por un proceso similar al descrito en 3' a 5'. Es posible que se omitan porciones del ARN viral durante la traducción.

Resultado

El resultado es que se pueden crear muchas proteínas diferentes a partir de la misma cadena de ARNm, con extremos 5' similares (en distintos grados) y los mismos extremos 3'. O bien, se pueden crear diferentes proteínas con ARN viral de sentido positivo.

La sección 5' de la cadena recién creada coincide con la de la cadena plantilla, y esta sección de la cadena plantilla se denomina "conjunto anidado". ^[2]

3' 5' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATACGTTATTTCTGCGCGGAAAAAAAAA - Plantilla original Strand 5' 3' GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCACGTTATATATAC---------------AAAAAAAAA | GCCGCCCCGTATCGATCGTAGCGCAC--------------------------AAAAAAAAA | = ARNm subgenómico. GCCGCCCCCGTAT----------------------------------------AAAAAAAAA |  GCCGCCCCGTAT = Conjunto anidado: indica saltos.

Ejemplos

Este complejo método de transcripción generalmente está restringido a virus , especialmente aquellos de ARN monocatenario de sentido positivo o virus de Clase IV que utilizan el Sistema de Clasificación de Baltimore , por ejemplo, virus del orden Nidovirales .

Se utiliza principalmente para compactar más información genética en una cantidad más corta de material genético. ^[3]

Literatura

1. Wu B, White KA (diciembre de 2007). "Desacoplar la replicación del virus ARN de la transcripción a través de la polimerasa: conocimientos funcionales y evolutivos". La Revista EMBO . 26 (24): 5120–30. doi :10.1038/sj.emboj.7601931. PMC  2140117 . PMID  18034156.
2. Le, TM; Wong, HH; Tay, FP; Colmillo, S; Keng, CT; Bronceado, YJ; Liu, DX (agosto de 2007). "Expresión, modificación postraduccional y caracterización bioquímica de proteínas codificadas por ARNm8 subgenómico del coronavirus del síndrome respiratorio agudo severo". FEBS J. 274 (16): 4211–22. doi : 10.1111/j.1742-4658.2007.05947.x . PMC 7164070 . PMID  17645546. 
3. Xu W, White KA (febrero de 2008). "Transcripción de ARNm subgenómico en un aureusvirus: regulación negativa de la transcripción y evolución de elementos reguladores de ARN". Virología . 371 (2): 430–8. doi : 10.1016/j.virol.2007.09.035 . PMID  17988704.