La temporada 2003-04 de la Southern Football League fue la número 101 en la historia de la liga, una competición de fútbol inglesa .
Fue la última temporada de la Southern Football League como liga de apoyo a la Conference Premier. Al final de la temporada, la Premier Division fue reemplazada como liga de nivel 6 (junto con la Northern Premier League Premier Division y la Isthmian League Premier Division) por las recién formadas Conference North y Conference South . La Premier Division perdió más de la mitad de sus clubes en favor de las divisiones recién formadas, y las dos divisiones regionales tuvieron varios de sus clubes ascendidos a la Premier Division para reemplazarlos. Por lo tanto, las divisiones de la Southern Football League descendieron a los niveles 7-8.
La Premier Division estaba formada por 22 clubes, incluidos 17 clubes de la temporada anterior y cinco clubes nuevos:
Crawley Town ganó la división y ascendió a la Conference National. Los clubes que terminaron en una posición superior a la 14.ª posición pasaron a las divisiones recién creadas Conference North y South, y los clubes que terminaron en una posición superior a la 18.ª posición y los ganadores de las divisiones Uno participaron en los play-offs para obtener dos puestos finales en Conference North/South.
Esta temporada no hubo descensos de la Premier Division, aunque, debido a la reforma de la liga, los clubes permanecieron en la división rebajados del sexto al séptimo nivel.
La División Este estaba compuesta por 22 clubes, incluidos 18 clubes de la temporada anterior y cuatro clubes nuevos:
La División Oeste estaba compuesta por 22 clubes, incluidos 18 clubes de la temporada anterior y cuatro clubes nuevos:
