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Proteopedia

Proteopedia es una wiki , una enciclopedia 3D de proteínas y otras moléculas . [1] [2] [3] [4]

Sitio web

El sitio contiene una página para todas las entradas del Protein Data Bank (PDB), así como páginas que son más descriptivas de las estructuras de proteínas en general, como la acetilcolinesterasa , [5] la hemoglobina , [6] y el fotosistema II [7] con una vista Jmol que resalta los sitios funcionales y los ligandos . Emplea una herramienta de creación de escenas para que los usuarios no tengan que aprender el lenguaje de script JSmol para crear escenas moleculares personalizadas. Las escenas personalizadas se adjuntan fácilmente a "enlaces verdes" en el texto descriptivo que muestran esas escenas en JSmol. Todo lo que se necesita es un navegador web para acceder al sitio y a la información 3D; no es necesario instalar ningún visor.

Proteopedia fue el ganador del premio 2010 al mejor sitio web de la revista The Scientist . [8]

Condiciones de licencia

Todo el contenido agregado por los usuarios es gratuito y está cubierto por la Licencia de Documentación Libre de GNU . Proteopedia está alojada en el Centro de Proteómica Estructural de Israel [9] en el Instituto de Ciencias Weizmann .

Referencias

  1. ^ Hodis E, Prilusky J, Martz E, Silman I, Moult J, Sussman JL (2008). "Proteopedia: una 'wiki' científica que salva las distancias entre la estructura tridimensional y la función de las biomacromoléculas". Genome Biol . 9 (8): R121. doi : 10.1186/gb-2008-9-8-r121 . PMC  2575511. PMID  18673581 .
  2. ^ Martz E (2009). "Proteopedia.Org: una "wiki" científica que cierra la brecha entre la estructura 3D y la función de las biomacromoléculas". Biopolímeros . 92 (1): 76–7. doi : 10.1002/bip.21126 . PMID  19117028.
  3. ^ Hodis E, Prilusky J, Sussman JL (2010). "Proteopedia: un recurso web colaborativo, virtual y en 3D para la estructura y función de proteínas y biomoléculas". Educación en bioquímica y biología molecular . 38 (5): 341–2. doi :10.1002/bmb.20431. PMID  21567857.
  4. ^ Prilusky, J; Hodis, E.; Canner, D.; Decatur, WA; Oberholser, K.; Martz, E.; Berchanski, A.; Harel, M.; Sussman, JL (agosto de 2011). "Proteopedia: un informe de situación sobre la enciclopedia web colaborativa en 3D de proteínas y otras biomoléculas". Revista de biología estructural . 175 (2): 244–252. doi :10.1016/j.jsb.2011.04.011. PMID  21536137.
  5. ^ "Acetilcolinesterasa". Proteopedia.
  6. ^ "Hemoglobina". Proteopedia.
  7. ^ "Fotosistema II". Proteopedia.
  8. ^ Luiggi C (septiembre de 2010). "Web Gems Presentamos a los ganadores de los primeros Labbies anuales, nuestros premios a los mejores productos multimedia basados ​​en la web por laboratorios: Ganador del sitio web: Proteopedia". The Scientist . 24 (9): 47. Archivado desde el original el 2011-04-12 . Consultado el 2010-12-15 . Muy absorbente. Me mantuvo mirando y jugando (y aprendiendo) con él durante mucho tiempo. Muy informativo y un buen recurso.
  9. ^ "El Centro de Proteómica Estructural de Israel". 12 de noviembre de 2015.

Enlaces externos