En la temporada 2012-13 de la Liga Bet , Beitar Nahariya (campeón de la división A Norte), Hapoel Beit She'an/Mesilot (campeón de la división B Norte), Hapoel Mahane Yehuda (campeón de la división A Sur) y Maccabi Be'er Ya'akov (campeón de la división B Sur) ganaron el título y el ascenso a la Liga Alef .
Los clubes ubicados del 2do al 5to lugar en cada división ingresaron a un play-off de ascenso, al final del cual, en la sección Norte, Hapoel Iksal perdió contra Maccabi Kafr Kanna de la Liga Alef Norte y permaneció en la Liga Bet , mientras que, en la sección Sur, FC Kafr Qasim ganó contra Hapoel Arad de la Liga Alef Sur y ascendió a la Liga Alef .
En la parte inferior, el FC Tzeirei Bir al-Maksur (de la división A Norte), el Ihud Bnei Baka (de la división B Norte), el Shikun Vatikim Ramat Gan (de la división A Sur) y el Bnei Yehud (de la división B Sur) descendieron automáticamente a la Liga Gimel .
Los clubes ubicados entre el 12.º y el 15.º lugar en cada división participaron en un play-off de descenso, al final del cual Hapoel Ahva Haifa (de la división A Norte), FC Kfar Kama (de la división B Norte), Gadna Tel Aviv (de la división A Sur) y Hapoel Merhavim (de la división B Sur) también descendieron a la Liga Gimel .
Hapoel Iksal se clasificó para el partido de play-off de ascenso contra el club número 14 en la división Liga Alef Norte, Maccabi Kafr Kanna .
Maccabi Kafr Kanna permaneció en la Liga Alef ; Hapoel Iksal permaneció en la Liga Bet .
El FC Kafr Qasim se clasificó para el partido de play-off de ascenso contra el club ubicado en el puesto 14 de la división Sur de la Liga Alef , el Hapoel Arad .
El FC Kafr Qasim asciende a la Liga Alef ; el Hapoel Arad desciende a la Liga Bet .