La 85ª Copa del Emperador se celebró entre el 17 de septiembre de 2005 y el 1 de enero de 2006. El torneo lo ganó Urawa Red Diamonds . Los clubes de la J.League División 2 se clasificaron automáticamente para la tercera ronda, mientras que los clubes de la J.League División 1 se clasificaron automáticamente para la cuarta ronda.