La Copa de Chipre 2006-07 fue la 65.ª edición de la Copa de Chipre . Participaron en la competición un total de 54 clubes. Comenzó el 16 de septiembre de 2006 con la primera ronda y concluyó el 12 de mayo de 2007 con la final, que se celebró en el estadio GSP . El Anorthosis ganó su décimo trofeo de la Copa de Chipre tras vencer al Omonia por 3-2 en la final.
En la Copa de Chipre 2006-07 participaron todos los equipos de la Primera División chipriota , la Segunda División chipriota , la Tercera División chipriota y 12 de los 14 equipos de la Cuarta División chipriota .
La competición se dividió en siete rondas. En la primera y la segunda ronda, cada eliminatoria se jugó a un solo partido y se disputó en el estadio de uno de los dos equipos, según el resultado del sorteo. Cada ganador de la eliminatoria se clasificaba para la siguiente ronda. En caso de empate, se jugaba una prórroga . En caso de empate, el ganador se decidía en la tanda de penaltis .
La tercera y cuarta ronda se jugaron en formato de ida y vuelta, en la que cada equipo jugó un partido de ida y otro de vuelta contra su oponente. El equipo que anotó más goles en el global se clasificaba para la siguiente ronda. Si los dos equipos anotaron el mismo número de goles en el global, entonces el equipo que anotó más goles fuera de casa avanzaba a la siguiente ronda.
Si ambos equipos habían marcado el mismo número de goles en casa y fuera, se jugaba una prórroga al final del partido de vuelta. Si durante los treinta minutos adicionales ambos equipos habían logrado marcar, pero habían marcado el mismo número de goles, entonces el equipo que había marcado los goles fuera de casa pasaba a la siguiente ronda (es decir, el equipo que jugaba fuera de casa). Si no se había marcado ningún gol durante la prórroga, el equipo clasificado se determinaba mediante la tanda de penaltis .
En la siguiente ronda (cuartos de final), los equipos se dividieron en dos grupos de cuatro. Los equipos de cada grupo se enfrentaron entre sí dos veces, una en casa y otra fuera. Los ganadores y subcampeones de cada grupo avanzaron a las semifinales.
Las semifinales se jugaron a doble partido y se aplicó el mismo formato que en la tercera y cuarta ronda. La final fue a partido único.
El ganador de la copa se aseguró un lugar en la Copa de la UEFA 2007-08 .
En la primera ronda participaron todos los equipos de la Segunda División y la Tercera División chipriota y 12 de los 14 equipos de la Cuarta División chipriota . Los dos equipos de la cuarta división que ascendieron de los play-offs de ascenso al STOK de 2006 a la Cuarta División chipriota 2006-07 tras quedar en segundo y tercer lugar ( Enosis Neon Parekklisia FC y Thiella Dromolaxia ) no participaron en la Copa de Chipre. El AEK Kouklia FC, que terminó primero en los play-offs de ascenso al STOK de 2006, participó en la Copa de Chipre.
En la segunda ronda participaron los ganadores de las eliminatorias de la primera ronda.
En la tercera ronda participaron los ganadores de las eliminatorias de la segunda ronda y seis equipos de la Primera División de Chipre (los equipos que terminaron en los puestos 9º, 10º y 11º en la Primera División de Chipre 2005-06 y los tres equipos que ascendieron de la Segunda División de Chipre 2005-06 ). Los ocho primeros equipos de la Primera División de Chipre 2005-06 no participaron en esta ronda.
En la cuarta ronda participaron los ganadores de las eliminatorias de la tercera ronda y los ocho equipos de la Primera División chipriota 2006-07 que no participaron en la tercera ronda, que fueron los equipos que terminaron en los primeros ocho lugares en la Primera División chipriota 2005-06 .
En la fase de grupos participaron los ocho ganadores de las eliminatorias de la cuarta ronda. Los equipos de cada grupo se enfrentaron entre sí dos veces, una en casa y otra fuera. Los ganadores y subcampeones de cada grupo avanzaron a la siguiente ronda.
En las semifinales participaron los cuatro equipos clasificados en la fase de grupos. Los partidos de ida se jugaron el 11 de abril y los de vuelta el 25 de abril.