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Dedo de zinc AN1

En biología molecular, el dominio de dedo de zinc de tipo AN1 , que tiene un pliegue alfa/beta unido a un dimetal (zinc) . Este dominio se identificó por primera vez como un dedo de zinc en el extremo C de AN1 SWISSPROT, una proteína similar a la ubiquitina en Xenopus laevis . [1] El dedo de zinc de tipo AN1 contiene seis cisteínas conservadas y dos histidinas que podrían coordinar potencialmente 2 átomos de zinc .

Algunas proteínas asociadas al estrés (SAP) contienen el dominio AN1, a menudo en combinación con dominios de dedo de zinc A20 (SAP8) o dominios C2H2 (SAP16). [2] Por ejemplo, la proteína humana Znf216 tiene un dedo de zinc A20 en el extremo N y un dedo de zinc AN1 en el extremo C, que actúan para regular negativamente la vía de activación de NFkappaB e interactuar con componentes de la respuesta inmunitaria como RIP, IKKgamma y TRAF6. La interacción de Znf216 con IKK-gamma y RIP está mediada por el dominio de dedo de zinc A20, mientras que su interacción con TRAF6 está mediada por el dominio de dedo de zinc AN1; por lo tanto, ambos dominios de dedo de zinc están involucrados en la regulación de la respuesta inmunitaria . [3] El dominio de dedo de zinc AN1 también se encuentra en proteínas que contienen un dominio similar a la ubiquitina, que están involucradas en la vía de ubiquitinación . [1] Las proteínas que contienen un dedo de zinc de tipo AN1 incluyen:

Los dominios de dedo de zinc de tipo AN1 están ampliamente presentes en diversas " Euryarchaeota " y Nitrososphaerota , donde a menudo se fusionan a dominios de peptidasa asociados a la membrana, como la serina peptidasa de la familia romboidal, las tiol peptidasas similares a la transglutaminasa del pliegue de papaína y las metalopeptidasas dependientes de Zn . Los dominios AN1 de Archaea también están vinculados a hélices transmembrana y dominios como DNAJ y SCP/PR1. Estas fusiones sugieren funciones asociadas a la membrana para las proteínas que contienen el dominio AN1 en Archaea, como en el procesamiento proteolítico de polipéptidos y en la regulación del plegamiento o la estabilidad de las proteínas. La sintaxis arquitectónica es notablemente similar a la de los dominios de dedo de zinc de caja B y LIM procariotas. [7]

Referencias

  1. ^ ab Linnen JM, Bailey CP, Weeks DL (junio de 1993). "Dos ARNm localizados relacionados de Xenopus laevis codifican proteínas de fusión similares a la ubiquitina". Gene . 128 (2): 181–8. doi :10.1016/0378-1119(93)90561-G. PMID  8390387.
  2. ^ Vij S, Tyagi AK (diciembre de 2006). "Análisis de todo el genoma de la familia de genes de la proteína asociada al estrés (SAP) que contiene los dedos de zinc A20/AN1 en el arroz y su relación filogenética con Arabidopsis". Mol. Genet. Genomics . 276 (6): 565–75. doi :10.1007/s00438-006-0165-1. PMID  17033811. S2CID  31769652.
  3. ^ Huang J, Teng L, Li L, Liu T, Li L, Chen D, Xu LG, Zhai Z, Shu HB (abril de 2004). "ZNF216 es un inhibidor de la activación de NFkappaB que interactúa con la quinasa gamma similar a A20 e IkappaB". J. Biol. Chem . 279 (16): 16847–53. doi : 10.1074/jbc.M309491200 . PMID  14754897.
  4. ^ Satou Y, Satoh N (diciembre de 1997). "Marca terminal posterior 2 (pem-2), pem-4, pem-5 y pem-6: genes maternos con ARNm localizado en el embrión de ascidia". Dev. Biol . 192 (2): 467–81. doi : 10.1006/dbio.1997.8730 . PMID  9441682.
  5. ^ Duan W, Sun B, Li TW, Tan BJ, Lee MK, Teo TS (octubre de 2000). "Clonación y caracterización de AWP1, una proteína novedosa que se asocia con la serina/treonina quinasa PRK1 in vivo". Gene . 256 (1–2): 113–21. doi :10.1016/S0378-1119(00)00365-6. PMID  11054541.
  6. ^ Liepinsh E, Leonchiks A, Sharipo A, Guignard L, Otting G (febrero de 2003). "Estructura de la solución del dominio R3H de Smubp-2 humana". J. Mol. Biol . 326 (1): 217–23. doi :10.1016/S0022-2836(02)01381-5. PMID  12547203.
  7. ^ Burroughs AM, Iyer LM, Aravind L (julio de 2011). "Diversificación funcional del dedo RING y otros dominios binucleares de clave de sol en procariotas y la evolución temprana del sistema de ubiquitina". Mol. Biosyst . 7 (1): 2261–77. doi :10.1039/C1MB05061C. PMC 5938088. PMID  21547297 . 
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