hipomicrobianos

Orden de las bacterias

Los Hyphomicrobianos (sinónimo Rhizobiales ) son un orden de Alfaproteobacterias Gram negativas .

Los rizobios , que fijan nitrógeno y son simbióticos con las raíces de las plantas, aparecen en varias familias diferentes. Las cuatro familias Nitrobacteraceae , Hyphomicrobiaceae , Phyllobacteriaceae y Rhizobiaceae contienen al menos varios géneros de bacterias microsimbióticas fijadoras de nitrógeno y noduladoras de leguminosas . Ejemplos de ello son los géneros Bradyrhizobium y Rhizobium . Las especies de Methylocystaceae son metanótrofas ; utilizan metanol (CH ₃ OH) o metano (CH ₄ ) como única fuente de energía y carbono. Otros géneros importantes son los patógenos humanos Bartonella y Brucella , así como Agrobacterium (útil en ingeniería genética ).

Taxonomía

Familias aceptadas

• Aestuariivirgaceae Li et al . 2019
• Afifellaceae Hördt et al . 2020
• Ahrensiaceae Hördt et al . 2020
• Alsobacteraceae Sun et al . 2018
• Amorphaceae Hördt et al . 2020
• Ancalomicrobiaceae Dahal et al . 2018
• Aurantimonadaceae Hördt et al . 2020
• Bartonellaceae Gieszczykiewicz 1939 (Listas aprobadas 1980)
• Beijerinckiaceae Garrity et al . 2006
• Blastocloridáceas Hördt et al . 2020
• Boseaceae Hördt et al . 2020
• Breoghaniaceae Hördt et al . 2020
• Raza Brucellaceae et al . 1957 (Listas aprobadas 1980)
• Chelatococcaceae Dedysh et al . 2016
• Cohaesibacteraceae Hwang y Cho 2008
• Devosiaceae Hördt et al . 2020
• Hyphomicrobiaceae Babudieri 1950 (Listas aprobadas 1980)
• Kaistiaceae Hördt et al . 2020
• Lichenibacteriaceae Pankratov et al . 2020
• Lichenihabitantaceae Noh et al . 2019
• Metilobacteriáceas Garrity et al . 2006
• Metilocistáceas Bowman 2006
• Nitrobacteraceae corrig. Buchanan 1917 (Listas aprobadas 1980)
• Notoacmeibacteraceae Huang et al . 2017
• Parvibaculaceae Hördt et al . 2020
• Phreatobacteraceae Hördt et al . 2020
• Phyllobacteriaceae Mergaert y columpios 2006
• Pleomorfomonadaceae Hördt et al . 2020
• Pseudoxanthobacteraceae Hördt et al . 2020
• Rhabdaerophilaceae Ming y col . 2020
• Rhizobiaceae Conn 1938 (Listas aprobadas 1980)
• Rhodobiaceae Garrity et al . 2006
• Roseiarcaceae Kulichevskaya et al . 2014
• Salinarimonadaceae Cole et al . 2018
• Segnochrobactraceae Akter et al . 2020
• Stappiaceae Hördt et al . 2020
• Tepidamorphaceae Hördt et al . 2020
• Xanthobacteraceae Lee y col . 2005

Géneros no asignados

El siguiente género no ha sido asignado a una familia:

• Flaviflagellibacter Dong y col . 2019 ^[3]

Taxones provisionales

Estos taxones han sido publicados, pero no han sido validados según el Código Bacteriológico :

• " Nordella " La Scola et al . 2004 ^[4]
• " Propylenellaceae " Liu et al . 2021 ^[5]
  • " Propilenella " Liu et al . 2021 ^[5]
    • " Propylenella binzhouense " Liu et al . 2021 ^[5]
• " Termopetrobacter " Sislak 2013 ^[6]

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas destacados en la nomenclatura ^[7] y la filogenia se basa en secuencias de todo el genoma. ^{[2] [un]}

Transformación genética natural

Se ha informado de transformación genética natural en al menos cuatro especies de Hyphomicrobianos : Agrobacterium tumefaciens , ^[8] Mmethylobacterium organophilum , ^[9] Ensifer adhaerens , ^[10] y Bradyrhizobium japonicum . ^[11] La transformación genética natural es un proceso sexual que implica la transferencia de ADN de una célula bacteriana a otra a través del medio intermedio y la integración de la secuencia del donante en el genoma del receptor mediante recombinación homóloga .

Ver también

• lar1

Notas

1. Aestuariivirgaceae , Alsobacteraceae , Ancalomicrobiaceae , Lichenibacteriaceae , Lichenihabitantaceae , Rhabdaerophilaceae y Segnochrobactraceae no están incluidas en este árbol filogenético.
2. Phyllobacterium está separado del resto de Phyllobacteriaceae .
3. Prosthecomicrobium está separado del resto de Hyphomicrobiaceae .

Referencias

1. Parker CT, Garrity GM (1 de enero de 2003). Parker CT, Garrity GM (eds.). "Resumen taxonómico de las familias: Mabikibacteraceae ". Los resúmenes de NamesforLife . Nombres para la vida, LLC. doi :10.1601/tx.30673.
2. Hördt A, López MG, Meier-Kolthoff JP, Schleuning M, Weinhold LM, Tindall BJ, et al. (2020). "El análisis de más de 1000 genomas de cepas tipo mejora sustancialmente la clasificación taxonómica de las alfaproteobacterias". Fronteras en Microbiología . 11 : 468. doi : 10.3389/fmicb.2020.00468 . PMC 7179689 . PMID  32373076. 
3. Dong L, Han MX, Wang D, Liu F, Asem MD, Jiao JY, Xiao M, Salam N, Li WJ (2019). " Faviflagellibacter deserti gen. nov., sp. nov., un nuevo miembro del orden Rhizobiales aislado de un suelo desértico". Antonie van Leeuwenhoek . 112 (6): 947–954. doi :10.1007/s10482-019-01228-0. PMID  30637538. S2CID  58006833.
4. La Scola B, Barrassi L, Raoult D (2004). "Una nueva alfa-Proteobacterium, Nordella oligomobilis gen. nov., sp. nov., aislada mediante el uso de cocultivos de amebas". Res Microbiol . 155 (1): 47–51. doi : 10.1016/j.resmic.2003.09.012 . PMID  14759708.
5. Liu YL, Meng D, Wang F, Gong XF, Gu PF, Fan XY, Du ZJ, Zou JD, Li Q (2021). " Propylenella binzhouense gen. nov., sp. nov. aislada de lodos activados y propuesta de Propylenellaceae fam. nov". Antonie van Leeuwenhoek . 114 (3): 225–233. doi :10.1007/s10482-020-01514-2. PMID  33400070. S2CID  230665484.
6. CD Sislak (2013). Nuevas bacterias termófilas aisladas de respiraderos hidrotermales marinos (Maestría). Universidad Estatal de Portland. doi : 10.15760/etd.1485 . 1486.
7. Euzéby JP, Parte AC. "Hifomicrobianos". Lista de nombres procarióticos con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 15 de mayo de 2021 .
8. Demanèche S, Kay E, Gourbière F, Simonet P (junio de 2001). "Transformación natural de Pseudomonas fluorescens y Agrobacterium tumefaciens en el suelo". Microbiología Aplicada y Ambiental . 67 (6): 2617–21. Código bibliográfico : 2001ApEnM..67.2617D. doi :10.1128/AEM.67.6.2617-2621.2001. PMC 92915 . PMID  11375171. 
9. O'Connor M, Wopat A, Hanson RS (enero de 1977). "Transformación genética en Mmethylobacterium organophilum". Revista de Microbiología General . 98 (1): 265–72. doi : 10.1099/00221287-98-1-265 . PMID  401866.
10. Zúñiga-Soto E, Mullins E, Dedicova B (2015). "Transformación mediada por Ensifer: un protocolo eficaz sin Agrobacterium para la modificación genética del arroz". SpringerPlus . 4 : 600. doi : 10.1186/s40064-015-1369-9 . PMC 4628045 . PMID  26543735. 
11. Raina JL, Modi VV (agosto de 1972). "Unión y transformación de desoxirribonucleato en Rhizobium jpaonicum". Revista de Bacteriología . 111 (2): 356–60. doi :10.1128/JB.111.2.356-360.1972. PMC 251290 . PMID  4538250. 

Otras lecturas

• Kuykendall LD, Dazzo FB (2005). " Allorhizobium ". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las proteobacterias alfa, beta, delta y épsilon, las proteobacterias, parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . vol. 2 (2ª ed.). Springer, Nueva York, Nueva York. págs. 345–346. ISBN 978-0-387-24144-9.
• Kuykendall LD (2005). "Género Azorhizobium ". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las proteobacterias alfa, beta, delta y épsilon, las proteobacterias, parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . vol. 2 (2ª ed.). Springer, Nueva York, Nueva York. págs. 505–506. ISBN 978-0-387-24144-9.
• Kuykendall LD (2005). "Género Bradyrhizobium , familia Bradyrhizobiaceae"". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). The Alpha-, Beta-, Delta- and Epsilonproteobacteria, The Proteobacteria, Part C, Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . Vol. 2 (2ª ed. ). Springer, Nueva York, NY, págs. 438–443. ISBN 978-0-387-24144-9.
• Kuykendall LD, Young JM, Martínez-Romero, Kerr A, Sawada H (2005). "Género Rhizobium , un género muy divergente en una familia revisada". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las proteobacterias alfa, beta, delta y épsilon, las proteobacterias, parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . vol. 2 (2ª ed.). Springer, Nueva York, Nueva York. págs. 324–340. ISBN 978-0-387-24144-9.
• Chen WX, Wang ET, Kuykendall LD (2005). "enus Mesorhizobium , familia Photobacteriaceae". En Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (eds.). Las proteobacterias alfa, beta, delta y épsilon, las proteobacterias, parte C, Manual de bacteriología sistemática de Bergey . vol. 2 (2ª ed.). Springer, Nueva York, Nueva York. págs. 403–408. ISBN 978-0-387-24144-9.