ELIXIR (la infraestructura europea de ciencias de la vida para la información biológica) es una iniciativa que permite a los laboratorios de ciencias de la vida de toda Europa compartir y almacenar sus datos de investigación como parte de una red organizada. Su objetivo es reunir a las organizaciones de investigación y los centros de datos de Europa para ayudar a coordinar la recopilación, el control de calidad y el almacenamiento de grandes cantidades de datos biológicos producidos por experimentos de ciencias de la vida . ELIXIR tiene como objetivo garantizar que los datos biológicos se integren en un sistema federado al que la comunidad científica pueda acceder fácilmente. [1]
La misión de ELIXIR es construir una infraestructura europea sostenible para la información biológica, apoyando la investigación en ciencias de la vida y su traducción a la medicina y el medio ambiente, las bioindustrias y la sociedad. [3]
Los resultados de los experimentos biológicos producen enormes cantidades de resultados que se almacenan como datos mediante software informático . Los países europeos han invertido mucho en investigación que produce, analiza y almacena información biológica. [4] Sin embargo, la recopilación, el almacenamiento, el archivo y la integración de estas grandes cantidades de datos plantean un problema que no puede ser abordado por un solo país. ELIXIR representa la unión de instalaciones de biociencia independientes para crear una red integrada que aborde el complejo problema del almacenamiento y la gestión de datos biológicos. Al proporcionar una estructura sostenible y distribuida para el manejo de datos y herramientas de recuperación de datos, ELIXIR espera asegurar una inversión a nivel europeo en bioinformática , proporcionando la estabilidad para realizar investigaciones en todas las áreas de las ciencias de la vida, tanto en el ámbito académico como en la industria. [1]
ELIXIR es una organización intergubernamental que reúne los recursos bioinformáticos existentes . Está coordinada por el ELIXIR Hub, con sede junto con el Instituto Europeo de Bioinformática del Laboratorio Europeo de Biología Molecular ( EMBL -EBI) en el Wellcome Trust Genome Campus en Hinxton, Cambridge.
Los miembros del consorcio ELIXIR son países europeos, representados por sus gobiernos y ministerios; la comunidad científica de cada país miembro desarrolla su Nodo nacional, que opera los servicios y recursos que forman parte de ELIXIR. Cada Nodo ELIXIR es en sí mismo una red de organizaciones nacionales de ciencias de la vida, coordinada por un instituto líder.
El Laboratorio Europeo de Biología Molecular es una organización intergubernamental, por lo que es el único Nodo que no está asociado a ningún país.
ELIXIR centra sus esfuerzos en cinco áreas centrales de actividad, denominadas Plataformas, que abarcan Datos, Herramientas, Computación, Interoperabilidad y Formación. El trabajo en estas áreas tiene por objeto mejorar el acceso a los recursos y herramientas de datos abiertos mejorando la conectividad, la capacidad de descubrimiento y el acceso a la potencia computacional, así como desarrollando formación para usuarios y proveedores de servicios para cumplir estos objetivos.
ELIXIR apoya a los usuarios que abordan los grandes desafíos de la investigación en ciencias de la vida en diversos dominios. ELIXIR apoya una variedad de comunidades autoseleccionadas, que se centran en temas de alto nivel como "Datos humanos" y "Ciencias de las plantas" hasta disciplinas más específicas y enfocadas como "Metabolómica" y "Proteínas intrínsecamente desordenadas", así como una comunidad dedicada al recurso "Galaxia". Estas comunidades existen para desarrollar estándares, servicios y capacitación en bioinformática y datos que se requieren para facilitar que esa comunidad alcance sus objetivos científicos.
A partir de septiembre de 2023, los siguientes países y EMBL-EBI han firmado el Acuerdo del Consorcio ELIXIR (ECA) para convertirse en miembros de ELIXIR: Bélgica, República Checa, Dinamarca, Estonia, Finlandia, Francia, Alemania, Grecia, Hungría, Irlanda, Israel, Italia, Luxemburgo, Países Bajos, Noruega, Portugal, Eslovenia, España, Suecia, Suiza y el Reino Unido.
Austria, Chipre y Rumania son países observadores y trabajan para ratificar el TLC en un futuro próximo.
A los países que han firmado el ECA se les asigna representación en el Consejo Directivo de ELIXIR.
La fase preparatoria de ELIXIR fue coordinada por la profesora Dame Janet Thornton del EMBL-EBI .
El director fundador de ELIXIR, el Dr. Niklas Blomberg, asumió su cargo en el nuevo ELIXIR Hub en Cambridge en mayo de 2013. [5] Dejó ELIXIR en diciembre de 2023 y el profesor Tim Hubbard fue nombrado nuevo director a partir de marzo de 2024. [6]
A finales de 2012, ELIXIR completó su fase preparatoria de cinco años financiada por el Séptimo Programa Marco de la UE [7] como parte del proceso del Foro Estratégico Europeo sobre Infraestructuras de Investigación (ESFRI).
En 2015, ELIXIR recibió una financiación de 19 millones de euros en el marco del programa HORIZON 2020 para ejecutar el proyecto EXCELERATE, al que siguió el proyecto CONVERGE en 2020. [8] [9] Ambos proyectos permitieron a ELIXIR coordinar y ampliar los recursos de datos nacionales e internacionales. [10] ELIXIR también ha establecido colaboraciones para solicitar otra financiación a gran escala para otros proyectos de la UE en los que también participa a título organizativo, por ejemplo, para los proyectos CORBEL, FAIRplus, EOSC-Life, B1MG, GDI y BY-COVID.
Cada estado miembro contribuye de manera conjunta a la financiación del Centro ELIXIR en proporción a su PIB. Algunos países han asignado nuevos fondos para contribuir a su Nodo ELIXIR. Los servicios y actividades de los Nodos ELIXIR seguirán siendo financiados por agencias nacionales. De manera colectiva, los miembros de ELIXIR solicitarán financiación externa adicional.
En 2024, ELIXIR inicia su cuarto programa científico de cinco años. [11]